Biološka raznovrstnost dveh virusov vinske trte in njun pomen za rastlino

Predlog projekta se nanaša na problematiko obstoja variabilnosti v zaporedju virusnih genomov pri splošno razširjenih patogenih virusih in biološkega pomena te variabilnosti. Predmet raziskave sta virus pahljačavosti listov vinske trte, Grapevine fanleaf virus (GFLV) in virus razbrazdanja rupestrisa na vinski trti, Grapevine rupestris stem pitting associated virus (GRSPaV). Oba virusa imata velik gospodarski pomen pri zdravstvenem varstvu in izbiri klonov vinske trte. GFLV povzroča hudo bolezen izrojenosti vinske trte, GRSPaV pa povezujejo z boleznijo razbrazdanja lesa vinske trte. Virusa se širita z okuženim sadilnim materialom, GFLV pa se širi tudi z naravnim prenašalcem ogorčico vrste Xiphinema index. Za GRSPaV naravni prenašalec zaenkrat še ni znan. Analize virusnega genoma nakazujejo, da oba virusa v naravi lahko nastopata v obliki različic njunega genoma, kar kaže na njuno biološko pestrost. Preliminarne raziskave kažejo na to, da lahko isto rastlino okužuje več virusnih različic hkrati in da obstaja možnost rekombinacij med njimi. Slednje bi lahko vplivalo na dinamiko virusnih populacij in na spremembe v sposobnosti virusov za prenos in povzročanje bolezni. Namen raziskav je prikaz naravne raznovrstnosti (opis variabilnosti virusnih populacij na podlagi analiz izbranih virusnih genov) in študij dinamike naravnih populacij virusov GFLV in GRSPaV na vinski trti v Sloveniji (pojav rekombinacij med posameznimi različicami z analizami in primerjavo zaporedij njihovih genomov) ter primerjava z drugimi, zlasti evropskimi izolati. Namen raziskave je tudi povezati to raznolikost z odnosom virusov do gostitelja - vinske trte (razvoj bolezenskih znamenj na nivoju rastlin, tkiv in celic). Morfološke karakteristike bomo opazovali z imunsko elktronsko mikroskopijo na ultratankih rezinah.