Z4-6807 — Letno poročilo 2015
1.
Razvoj integrirane zbirke znanja pri govedu

Uporaba pristopov sistemske biologije pri reji živali predstavlja priložnost za boljše izkoriščanje v živinorejski proizvodnji. Vedno podrobnejše raziskave sistemske biologije so privedle do velike količine podatkov, razpršenih v različnih virih; zato potrebujemo centralizirano zbirka znanja. V tej študiji smo zbrali raznovrstne genomske podatke ter razvili bioinformacijsko orodje za študij povezav genotip/fenotip pri govedu.

COBISS.SI-ID: 3622280
2.
Polimorfizmi v genih za mikro RNA pri raku: Analiza literature

Polimorfizmi posameznih nukleotidov (angl. single nucleotide polymorphism; SNP), ki se nahajajo v genih za microRNA (miRNA) (miR-SNP) so v zadnjih letih pritegnili veliko pozornost zaradi svoje vpletenosti v razvoj različnih vrst raka. Zato je potreben sistematičen pregled področja. Naša raziskava je pokazala, da kljub velikemu številu znanih variacij znotraj genov za miRNA pri ljudeh, pri večina še ni bila raziskana povezava z rakom.

COBISS.SI-ID: 3609992
3.
In silico pregled genetske variabilnosti mikro RNA genov pri sedmih rastlinskih vrstah na ravni celotnega genoma

Raziskave so pokazale, da so polimorfizmi znotraj genov za microRNA povezani s pomembnimi proizvodnimi lastnostmi pri rastlinah. Genetska variabilnost genov za mikro RNA je bila sistematično raziskana samo pri rižu. V tej študiji smo uporabili posodobljeno bioinformacijsko orodje miRNA SNiPer, ki omogoča raziskavo 22 genomov, od tega 7 rastlinskih.

COBISS.SI-ID: 3663752