Razvili smo nov pristop za načrtovanje vektorjev za sintezno biologijo rastlin. Genetski jezik je bil formaliziran in implementiran v programskem orodju GenoCAD, ki omogoča načrtovanje konstruktov za uporabo v sintezni biologiji. Vključuje knjižnico bioloških elementov, organiziranih v strukturne kategorije in nabor pravil, ki določajo sestavljanje elementov v daljše konstrukte. Postavili smo pravila za tri tipe aplikacij v sintezni biologiji rastlin 1) študij lokalizacije proteinov 2) analiza promotorjev in 3) študij interakcije med proteini. Tako GenoCAD omogoča lažjo načrtovanje ekspresijskih vektorjev in s tem funkcionalne analize na različnih področjih biologije rastlin.
COBISS.SI-ID: 3528271
Izvedli smo celovito študijo analize dinamičnih sprememb primarnega metabolizma krompirja po okužbi z virusom PVY, ki je vključevala analizo celotnega transkriptoma, netarčne analize proteoma ter meritve fotosintetske aktivnost v rastlinah sorte Désirée ter transgenih linijah NahG-Désirée. Pokazali smo, da je odziv rastlin na transkripcijski ravni obširen in bimodalen, vendar se le delno manifestiara v spremembah na ravni proteoma, ter končnih spremembah na nivoju fotosintetske aktivnosti.
COBISS.SI-ID: 3614031