J7-6781 — Zaključno poročilo
1.
Nova storitev za daljinsko kvantitativno analizo magnetno resonančnih slik bolnikov z multiplo sklerozo

Razvili smo novo storitev (https://ms.quantim.eu), ki iz rutinsko zajetih MR slik omogoča zanesljive in klinično koristne meritve števila, volumnov in leg lezij bele možganovine in izgube možganovine (atrofijo), ter meritve sprememb teh parametrov skozi čas. Storitev omogoča direktno pošiljanje anonimiziranih MR slik bolnikov z multiplo sklerozo iz kliničnega okolja na strežnik za obdelavo MR slik, ki je trenutno na Fakulteti za elektrotehniko. Skupaj z nevrologi in nevroradiologi smo tudi določili protokol zajemanja MR slik. Magnetno resonančne slike se s programsko opremo, ki je bila razvita in validirana v okviru tega projekta, obdelajo in analizirajo v največ 3 urah po prejetju slik. Kvantitativni podatki o za multiplo sklerozo pomembnih možganskih strukturah in njihovih spremembah se vnesejo v poročilo (glej prilogo), ki se vrne nevrologu in/ali nevrologu na ustrezni zdravstveni ustanovi. Med projektom smo vzpostavili povezavo našega strežnika z vsemi bolnišnicami (UKC Ljubljana, UKC Maribor, Jesenice, Celje, Novo Mesto, Izola, Murska Sobota, Slovenj Gradec, Šempeter ter UKC LJ pediatrija), ki obravnavajo bolnike z multiplo sklerozo. Do sedaj smo obdelali cca 900 MR slik cca 600 bulnikov z multiplo sklerozo. Odzivi nevrologov in nevroradiologov so zelo pozitivni.

F.11 Razvoj nove storitve

2.
Ustanovitev novega podjetja ("spin off")

Storitev https://ms.quantim.eu je trenutno za slovenske zdravstvene ustanove brezplačna. Za namen bodočega trženja storitve doma in v tujini smo v začetku leta 2016 ustanovili podjetje INTELITEH d.o.o. (http://www.bizi.si/INTELITEH-D-O-O/). Podjetje se predvsem ukvarja z razvojem (nadgradnjo) in trženjem te storitve ter z razvojem in trženjem novih storitev na področju slikovno podprte diagnostike, načrtovanja in simulacij terapij, slikovno vodenih terapi, ter slikovno podprtega spremljanja napredovanja bolezni in učinkov terapij.

F.20 Ustanovitev novega podjetja ("spin off")

3.
Optimizacija in sistematizacija protokolov zajema MR slik za spremljanje bolnikov z multiplo sklerozo

V Sloveniji je v uporabi več kot ducat različnih MR naprav, ki imajo vsaka specifične nastavitve in protokole zajema MR slik. Za izboljšanje in poenotenje kakovosti avtomatske kvantifikacije MR slik (https://ms.quantim.eu) zajetih z različnimi aparati smo v okviru projekta vzpostavili neposredne komunikacijske kanale z radiološkimi oddelki obeh kliničnih centrov (Lj in Mb) ter sedmimi regionalnimi bolnišnicami. Z našo povratno informacijo o kakovosti slik smo optimizirali nastavitve parametrov posamezni MR aparatov, tako da je zajeta slika optimalne kakovosti za avtomatsko analizo kot tudi za očno branje. Novo postavljeni MR protokoli zajema slik so izotropni 3D, v primerjavi s prejšnjimi neizotropnimi 2D, in bolj podrobno prikazujejo pomembne strukture možganov, ki jih običajno prizadenejo nevrološke bolezni, kot je npr. multipla skleroza. Prednosti novega protokola so potrdili nevroradiologi in nevrologi, na podlagi njihovega pozitivnega odziva pa je zavod za Zdravstveno Zavarovanje Slovenije (ZZZS) vpeljal tudi novo šifro MR protokola zajema ID.št. 11007 pod imenom Multipla skleroza s 3D.

F.22 Izboljšanje obstoječih zdravstvenih/diagnostičnih metod/postopkov

4.
Baza magnetno resonančnih slik

Do sedaj smo obdelali cca 900 MR slik cca 600 bolnikov z multiplo sklerozo. Baza magnetno resonančnih slik, ki so bile zajete na MR napravah treh proizvajalcev: Philips, Siemens in General Electric in različnih generacij naprav, predstavljajo izredno dragoceno slikovno bazo, katero lahko in bomo uporabili za razvoj in validacijo izboljšanih algoritmov ter za longitudinalno spremljanje stanja bolnikov.

F.15 Razvoj novega informacijskega sistema/podatkovnih baz

5.
Avtomatska segmentacija normalnih in patoloških struktur magneto resonančnih slik

Na temo raziskovalnega projekta sta doktorirala dva mlada raziskovalca. Alfiia Galimzianova z disertacijo Avtomatska segmentacija normalnih in patoloških struktur magneto resonančnih slik in Žiga Lesjak z disertacijo Avtomatska zaznava sprememb bele možganovine v magnetno resonančnih slikah. Dr. Galimzianova je objavila 4 izvirne znanstvene članke v tujih revijah. Članek v NeuroImage 2016 sodi v razred A''. Dr. Galimzianova je trenutno podoktorska študentka na univerzi Stanford ZDA (https://profiles.stanford.edu/alfiia-galimzianova). Dr. Žiga Lesjak je samostojni podjetnik.

D.09 Mentorstvo doktorandom

COBISS.SI-ID: 11167316