J3-6788 — Letno poročilo 2015
1.
Korelacija pozitivne kulture, pozitivnega PCR in bremena Borrelia burgdorferi sensu lato v vzorcih kože bolnikov z erythema migrans s kliničnimi ugotovitvami

Izhodišča: Podatki o povezavi med borelijskim bremenom v vzorcih kože bolnikov z erythema migrans (EM) in kliničnim potekom bolezni ter izhodom zdravljenja so skopi. Metode: bioptične vzorce 121 odraslih bolnikov z EM smo kultivirali in analizirali s kvantitativnim PCR za ugotavljanje prisotnosti borelij. Oceno kliničnih in mikrobioloških podatkov smo izvedli ob vključitvi ter 14 dni, 2, 6 in 12 mesecev po zdravljenju bodisi z amoksicilinom ali cefuroksim aksetilom. Rezultati: V kožnih vzorcih 94/121 (77.7 %) bolnikov smo borelije dokazali s PCR, 65/118 (55.1 %) bolnikov pa je imelo pozitiven izvid kulture (96.8 % B. afzelii, 3.2 % B. garinii). Rezultati borelijske kulture in PCR so bili pomembno povezani s prisotnostjo obročaste rdečine in velikostjo EM, borelijsko breme pa je pomembno koreliralo s prisotnostjo obročaste rdečine, velikostjo EM ter prisotnostjo simptomov, ki so se pojavili na novo ali ojačali od pojava EM in zanje nismo imeli jasne medicinske razlage (novi ali ojačani simptomi, angl. new or increased symptoms, NOIS). Model logistične regresije za ponavljajoče spremenljivke, ki je upošteval čas od vključitve, je pokazal, da je višje borelijsko breme dejavnik tveganja za nepopolni uspeh (definiran kot NOIS in/ali vztrajanje EM po 14 dneh in/ali pojav novih objektivnih znakov lymske borelioze). Ocenjena povezava med pozitivnim PCR in neugodnim izhodom je bila močna, vendar ni bila statistično pomembna, za pozitiven izvid kulture pa ni bilo ustrezne povezave. Zaključki: Višje borelijsko breme v kožnih vzorcih bolnikov z EM je bilo povezano z večjo pogostostjo obročastih EM in večjo velikostjo EM ob vključitvi ter z večjo verjetnostjo nepopolnega uspeha po zdravljenju.

COBISS.SI-ID: 32176601
2.
medplot: mrežna aplikacija za dinamično povzemanje in analizo longitudinalnih zdravstvenih podatkov, ki sloni na R.

V biomedicinskih raziskvah se bolnike pogosto ocenjuje večkrat, ob vsaki oceni pa se zabeleži več spremenljivk. Vnos podatkov in obdelava longitudinalnih podatkov se lahko izvede z uporabo posebnih programov, ki običajno omogočajo delno analizo podatkov in so enostavni za uporabo, vendar ne omogočajo analize kompleksnih longitudinalnih podatkov. Specializirana statistična programska oprema je bolj prožna in zmogljiva, vendar je za začetnike brez biomedicinskega predznanja pogosto zapletena. Razvili smo medplot, interaktivno mrežno aplikacijo, ki poenostavi pogled v in analizo longitudinalnih podatkov. Aplikacijo lahko uporabijo raziskovalci, ki niso vešči statističnih programov in nimajo statističnega znanja za povzemanje, vizualizacijo in analizo podatkov. Orodja za povzemanje izdelajo tabele in grafe v obliki, pripravljeni za objavo. Orodja za analizo vsebujejo lastnosti, ki so redke dostopne pri običajni programski opremi, kot so popravki zaradi multiplega testiranja, analiza ponavljajočih meritev in fleksibilno nelinearno modeliranje povezave med numeričnimi spremenljivkami in izhodom. medplot jeprosto dostopen in odprt vir, ima intuitivno grafično podobo, dostopen je na medmrežju in se ga da uporabiti lokalno na uporabnikovem računalniku brez namestitve ali potrebe vzdrževalnih programov. V članku je opisana uporaba aplikacije ter so podani natančni primeri uporabe aplikacije za resnične podatke iz klinične raziskave, ki je vključevala bolnike z zgodnjo lymsko boreliozo.

COBISS.SI-ID: 31924697
3.
Primerjava kliničnih in laboratorijskih značilnosti bolnikov, ki so izpolnejvali merila za dokazano in verjetno humano granulocitno anaplazmozo

Da bi ocenili vrednost kliničnih definicij za humano granulocitno anaplazmozo (HGA), smo primerjali epidemiološke, klinične in laboratorijske značilnosti 50 odraslih bolnikov s potrjeno HGA (Anaplasma phagocytophilum izolirana iz krvi in/ali pozitiven PCR rezultat in/ali serokonverzija ali 4-stopenjska sprememba titra serumskih protiteles proti A. phagocytophilum določenih z metodo IFA) in značilnosti 46 bolnikov z verjetno HGA (dokaz serumskih protiteles proti A. phagocytophilum v titru ≥1:256). Bolniki s potrjeno HGA so bili starejši (55 versus 43,5 let; p = 0,001), pogosteje so bili zdravljeni z doksiciklinom (31/50, 62 % versus 11/46, 23,9 %; p ( 0,001), pogosteje so imeli mrzlico (40/50, 80 % versus 17/46, 36,9 %; p ( 0,001), mialgije (37/50, 74 % versus 21/46, 45,7 %; p = 0,005) in kašelj (10/50, 20 % versus 2/46, 4,4 %; p = 0,02), pogosteje so imeli nenormalne izvide laboratorijskih preiskav kot so trombocitopenija (45/50, 90 % versus 22/46, 47,8 %; p ( 0,001), nenormalni rezultati testov jetrne funkcije (45/50, 87 % versus 22/46, 47,8 %; p ( 0,001), levkopenija (38/50, 76 % versus 21/46, 45,7 %; p = 0,002) in povišano koncentracijo CRP (48/50, 96% versus 31/46, 67,4%; p ( 0,001). Razlike nakazujejo, da pri nekaterih bolnikih, ki izpolnjujejo merila za verjetno HGA, znaki in simptomi najverjetneje niso posledica nedavne okužbe z A. phagocytophilum in kažejo, da imajo klinične definicije, uporabljene v tej raziskavi, razločevalni pomen.

COBISS.SI-ID: 32345305