P1-0012 — Letno poročilo 2015
1.
Strukturno podprto načrtovanje novih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze II [alfa]

Dr. Barbara Pogorelčnik je za svojo doktorsko disertacijo: Strukturno podprto načrtovanje novih zaviralcev človeške DNA topoizomeraze IIα prejela Krkino nagrado za raziskovalno delo (mentor: prof. dr. Tomaž Šolmajer, somentor: doc. dr. Andrej Perdih).

E.01 Domače nagrade

COBISS.SI-ID: 5803290
2.
Raziskovalna dejavnost in delo raziskovalca

Izvedeno vabljeno predavanje o raziskovalni dejavnosti v RS in delu raziskovalca v okviru Kapsule priložnosti, Fakulteta za farmacijo, Ljubljana, 2. 4. 2015

B.04 Vabljeno predavanje

COBISS.SI-ID: 5676826
3.
Narava medmolekularnih sil in prepoznavanje v bioloških makromolekulah

Na konferenci Slovenskega toksikološega društva; Kemijski povzročitelji hormonskih motenj od molekule do človeka je dr.Mavri predstavil naravo intermolekularnih sil, ki so odgovorne za prepoznavanje med ligandom in receptorjem

D.10 Pedagoško delo

COBISS.SI-ID: 5689882
4.
Računska encimologija na osnovi metode empirične valenčne vezi: oksidacija aminov z encimom monoamino oksidaza

Član programske skupine je predstavil znanstvene dosežke pri raziskavah encimske oksidativne razgradnje aminov v centralnem živčnem sistemu. Ker ima reakcija pomembno vlogo pri razvoju nevrodegenerativnih bolezni, je njeno razumevanje bistvenega pomena za preprečevanje bolezni in lajšanje simptomov. Predavatelj je posebej izpostavil raziskave točkovnih mutacij encima in njihovega vpliva na hitrost reakcije. Predavatelj je vodil tudi študentsko delavnico, na kateri so se slušatelji naučili uporabljati napredne metode sodobne računske encimologije.

B.05 Gostujoči profesor na inštitutu/univerzi

COBISS.SI-ID: 5822746
5.
Multiskalna računska encimologija: simulacija encimske razgradnje benzilamina z metodo empirične valenčne vezi

Razgradnja primarnih aminov z encimom monoamino oksidaza ima pomembno vlogo v farmakologiji centralnega živčnega sistema. Predstavili smo računske študije, s katerimi smo proučevali mehanizem encimske reakcije. Posebej smo osvetlili vlogo tuneliranja, ki smo ga modelirali z lastno metodologijo posnetkov reakcijske dinamike ter s kvantizacijo gibanja atomskih jeder. V primeru monoamino oksidaze je vloga tuneliranja opazna, ni pa odločilna, kar se dobro ujema z eksperimentalnimi kinetičnimi študijami.

B.04 Vabljeno predavanje

COBISS.SI-ID: 5715482