J4-5526 — Letno poročilo 2013
1.
Vpliv povečane koncentracije CO2 na združbe talnih arhej in bakterij

Vpliv abiotskih dejavnikov okolja na biodiverziteto ter sestavo združb številnih funkcionalno pomembnih skupin mikroorganizmov je v različnih kopenskih ekosistemih še vedno slabo raziskano področje. V članku je predstavljena molekularna karakterizacija arhejskih in bakterijskih združb, izpostavljenih dolgoročnim spremembam abiotskih dejavnikov v tleh na območjih naravnih izvirov CO2 ali mofet. Rezultati kažejo na velike spremembe v sestavi združb obeh raziskovanih skupin mikroorganizmov v smeri večjega števila anaerobnih in metanogenih taksonov, ki dominirajo v hipoksičnih tleh. Z geološkim plinom inducirana hipoksija lahko na območjih mofet povzroči velike spremembe v sestavi združb talnih mikrobov, te pa lahko močno vplivajo na delovanje ekosistemov (npr. kroženje hranil in metanogenezo). Povzemamo, da so mofete lahko dobri modelni ekosistemi za raziskovanje odziva naravnih mikrobnih združb na dolgoročne okoljske spremembe.

COBISS.SI-ID: 7763321
2.
Desetletje raziskav na območjih mofet nam je omogočilo nove vpoglede v adaptacijo mikroorganizmov na abiotski stres

V preglednem članku so predstavljene raziskave s področja mikrobne ekologije, ki opisujejo vplive sprememenjenih koncentracij talnih plinov na združbe arbuskularnih mikoriznih gliv, arhej in bakterij. Skupaj s hitrim razvojem novih molekulskih pristopov, predvsem novih generacij visokozmogljivega paralelnega sekvenciranja, ki poganjajo področje molekularne ekologije, mofete omogočajo raziskovanje vpliva abiotskih dejavnikov okolja na biodiverziteto in strukturo združb teh funkcionalno pomembnih skupin talnih mikrobov.

COBISS.SI-ID: 7770745
3.
K poenotini paradigmi za identifikacijo gliv na osnovi sekvenc

Regija ITS (nuclear ribosomal internal transcribed spacer region) je ponavadi molekulski marker, ki se uporablja za raziskovanje diverzitete gliv v okoljskih raziskavah. Pri identifikaciji na novo generiranih sekvenc ITS se pojavljata dve težavi: (i) primanjklaj celostne, zaneslijive in javne referenčne baze podatkov (ii) pomanjkanje orodij, s katerimi bi se bilo možno na standardiziran način sklicevati na vrste gliv, za katere ni uradnega latinskega imena. V članku je opisan napredek na tem področju, povezan z razvojem baze UNITE (http://unite.ut.ee) za molekularno identifikacijo gliv.

COBISS.SI-ID: 3693990