J3-5502 — Letno poročilo 2015
1.
Proteomske analize razkrivajo vpliv izgube TDP-43 na procesiranje RNA in znotrajcelični transport

V tem prispevku predstavljamo proteomsko študijo, s katero smo analizirali vpliv izgube TDP-43 na proteom. Podatki masne spektrometrije z identifikatorjem PXD001668 so dostopni preko ProteomeXchange. Naši rezultati nakazujejo, da je TDP-43 pomemben regulator metabolizma RNA in znotrajceličnega transporta. Pokazali smo, da se po utišanju TDP-43 zmanjša nivo Ran-vezavnega proteina 1 (RanBP1), DNA-metiltransferaze 3 alfa (Dnmt3a) in kromogranina B. Kot rezultat pomanjkanja RanBP1, se poveča nivo transportina 1. Neustrezna regulacija teh proteinov in posledično celičnih procesov lahko igra vlogo pri patogenezi ALS in FTLD, ki jih zaznamuje proteinopatija TDP-43.

COBISS.SI-ID: 28427047
2.
Fosforilacija C-končnega tirozina prepreči vnos proteina FUS v jedro

Članek je bil izpostavljen v uvodnem delu revije JCS ('in this issue'). Protein FUS se pri približno 10 % bolnikov s frontotemporalno lobarno degeneracijo (FTLD) nahaja v citoplazemskih vključkih namesto v jedru. Z mikroskopijo primarnih nevronov in imunoprecipitacijo smo pokazali, da je C-končen tirozin v proteinu FUS ključen za transport proteina FUS preko jedrne membrane. V nadaljevanju smo ugotovili, da je omenjeni tirozin podvržen fosforilaciji, ki zmanjša jakost vezave transportina 1. Transportin 1 veže protein FUS in ga prenese v jedro. Posledično lahko fosforilacija C-končnega tirozina vpliva na jedrni transport proteina FUS. Sprememba fosforilacijskega stanja C-končnega tirozina v proteinu FUS je potencialni vzrok za patološko redistribucijo proteina FUS v citoplazmo pri FTLD.

COBISS.SI-ID: 29044263