J1-5444 — Zaključno poročilo
1.
Asimetrija molekularnih procesov v absciziji pri paradižniku

V absciziji pri paradižniku potekajo različni procesi v delu peclja, obrnjenem proti listu oz. cvetu, ki odpade (distalno), in delu proti rastlini (proksimalno). V distalnem delu je pomemben proces programirana celična smrt, izražajo se nukleaze in encimi vključeni v oksidativni stres. V proksimalnem delu so celice žive in metabolno aktivne. V abscizinskem območju se izražajo encimi za razgradnjo osrednjih lamel, spreminja se izražanje genov vključenih v metabolizem etilena.

COBISS.SI-ID: 28604199
2.
Vloga endoreduplikacije v sposobnosti rastlin za regeneracijo

V prispevku opisujemo vpliv stopnje endoreduplikacije na regeneracijo rastlin iz izsečkov kličnih listov buče. Endoreduplikacija je oblika celičnega cikla, kjer se DNA večkrat podvoji. Endoreduplicirane celice se ne delijo več, zato negativno vpliva na sposobnost rasti z delitvijo celic.

COBISS.SI-ID: 7983737
3.
Hitra metoda pomnoževanja nukleinskih kislin LAMP za detekcijo fitoplazem ima enako zmogljivost kot qPCR

V Evropi fitoplazme povzročajo veliko škodo na vinski trti, zato smo razvili hitro in učinkovito metodo za detekcijo s pomnoževanjem nukleinskih kislin pri konstantni temperaturi (LAMP), ki se jo izvede na terenu. Natančnost in občutljivost je primerljiva s kvantitativnim pomnoževanjem PCR v realnem času.

COBISS.SI-ID: 4088399
4.
Digitalni kapljični PCR z reverzno transkripcijo v enem koraku

V članku je prvič opisana metoda verižne reakcije s polimerazo, ki v enem koraku vključuje tudi reverzno transkripcijo RNA, v mikronskih kapljicah, v katerih zaznamo absolutne količine RNA virusov v različnih vzorcih vode. Metoda kvantifikacije je natančnejša in bolj tolerantna na prisotnost inhibitorjev, kot standardna metoda PCR v realnem času z reverzno transkripcijo. Opisana metoda je predvsem primerna za kvantifikacijo RNA virusov v nizkih koncentracijah v vzorcih vode.

COBISS.SI-ID: 2990415
5.
Avtomatizirana izolacija DNA iz večjega števila rastlinskih vzorcev

Opisana metoda je hiter postopek za izolacijo DNA iz večjega števila vzorcev rastlin. V postopku je uporabljena preprosta in hitra homogenizacija grobih ekstraktov, ter izolacija DNA s pomočjo vezave DNA na magnetne kroglice. DNA se očisti v avtomatiziranem procesu, v katerem se magnetne kroglice prenesejo skozi serijo pufrov za spiranje. Eluirana DNA je primerna za pomnoževanje v PCR reakcijah.

COBISS.SI-ID: 2614095