Protein imunosti Imu3 je del otoka patogenosti PAIUsp, ki ščiti producenta pred nukleazno aktivnostjo proteina Usp. V PAIUsp sta še dva gena imunosti, vendar smo dokazali, da Imu3 nudi producentu najbolj učinkovito zaščito. Medtem ko se pri nukleaznih bakteriocinih E. coli, proteini imunosti vežejo z veliko afiniteto z aktivnim mestom bakteriocina, protein Imu3 ščiti producenta z nespecifično vezavo na DNA. Protein ima veliko afiniteto za DNA, jo že pri nizkih koncentracijah precipitira, zato menimo, da ima biotehnološki potencial.
COBISS.SI-ID: 3037263
Opisan je LexA regulon pomembnega patogena človeka, Clostridium difficile. Z in silico analizo in površinsko plazmonsko resonanco smo določili 16 LexA vezavnih zaporedij v genomu C. difficile. Poleg osrednjih SOS genov lexA, recA, ruvCA in uvrBA,smo identificirali LexA vezavna zaporedja v PaLoc (lokus patogenosti) kakor tudi v nekaj hišnih genih, genih sporulacije in odpornosti proti antibiotikom.
COBISS.SI-ID: 3097423
V kraških jamah pogosto zasledimo makroskopske kolonije bele, rumene, sive ali roza barve, ki jih speleologi imenujejo 'jamsko srebro'. Preučili smo mikrobno raznolikost jamskih izolatov jamskega srebra odvzetega v jami Pajsarjeva v bližini Vrhnike. Na osnovi zaporedja gena za 16S rRNA smo izolate uvrstili v rodove Streptomyces (25%), Micrococcus ( 16 %), Rhodococcus (10 % ), Pseudomonas (9 %), Agrobacterium (8 %), Lysobacter (6 %) in Paenibacillus (5 %). Predstavniki rodov Microbacterium, Agrococcus, Arthrobacter, Bacillus, Kocuria, Oerskovia, Sphingomonas, Aerococcus in Bosea so predstavljali manj kot 5% sevov.
COBISS.SI-ID: 3063375
Bakterije izkazujejo raznolikost tako znotraj vrste kakor tudi medvrstno v naravnih okoljih. Primer vrste z velikim naborom sevov, ki se razlikujejo v fiziologiji, virulenci in odpornosti proti antibiotikom je bakterija Escherichia coli. Raznolikost je pomembna tudi v evoluciji vrst, ki so se tekom evolucije prilagodile na ekstremna okolja.
COBISS.SI-ID: 3178575
Objavili smo genomska zaporedja štirih varietet črne kvasovke Aureobasidium pullulans s poudarkom na prisotnost in značilnosti genov, vpletenih v toleranco na stres, zlasti na visoke koncentracije soli, ki jih vrste rodu Aureobasidium dobro prenašajo. Osredotočili smo se tudi na prisotnost biotehnološko pomembnih genov in opisali varietete kot nove vrste na podlagi razlik med genomi. Članek je bil objavljen v ugledni znanstveni reviji ustreznega raziskovalnega področja in je bil (tudi zaradi velikega pomena vrst Aureobasidium spp. v biotehnologiji, pa tudi v kmetijstvu in medicini) deležen večjega števila odzivov.
COBISS.SI-ID: 3173711