1.

Struktura in sestava skupkov bakterij v podzemni vodi Dinarskega krasa

Jama Vjetrnica izkazuje izkazuje izjemno biodiverziteto vključno z brstom podobne strukture/agregate v strugi potoka jame. Mikrobni agregati so bili preučeni na podlagi analize rRNA in mikroskopije. Agregati so izrazito morfološko urejeni s sredico iz Candidatus Troglogloea absoloni. Površina agregatov je bolj raznolika kot sredica in je kolonizirana z biofilmom pretežno iz filamentoznih Betaproteobakterij, medtem ko so druge mikrobne populaicje skorje iz Bacteriodetes, Gammaproteobacteria, Actinombacteria, Alphaproteobacteria, in Planctomycetes, z vključki mineralov .

COBISS.SI-ID: 2711375

2.

Interakcija proteinov LexA RecA

Porajanje odpornosti proti antibiotikom lahko zavremo z inhibicijo interakcije poglavitnih regulatorjev odziva SOS, proteinov RecA in LexA. Z namenom priprave inhibitorjev njune interakcije smo izdelali 3D model, ki je pokazal, da N in C terminalni domeni LexA interagirata z aktiviranim RecA proteinom - RecA*.

COBISS.SI-ID: 26953767

3.

Uropatogeni specifični protein bakterije Escherichia coli Usp, je bakteriocinu podoben genotoksin

C terminalna domena proteina Usp je homologna kolicinu E7 vendar kljub temu vstopa v evkariontske celice kjer izzove fragmentacijo genoma in apoptozo.

COBISS.SI-ID: 2871119

4.

Izolacija in karakterizacija nove psihrotrofne bakterijske vrste, ki producira pigment podoben violaceinu, Janthinobacterium svalbardensis sp. nov

Iz vzorca ledu ledenika otoka Spitsbergen (Arktika) je bila izolirana bakterija JA-1, sorodna Janthinobacterium lividum. Raziskali smo fenotipske lastnosti in najizrazitejša je temno rdeča rjava do črna pigmentiranost, ki se razlikuje od violičnega pigmenta Janthinobacterium, Chromobacterium in Iodobacter. Filogenetska analiza na osnovi zaporedij genov za 16S rRNA in hibridizacij DNA-DNA je pokazala, da sev JA-1 sodi v rod Janthinobacterium vendar predstavlja novo linijo. Predlagamo, da je tipski sev nove vrste rodu Janthinobacterium, s predlaganim imenom Janthinobacterium svalbardensis sp. nov.

COBISS.SI-ID: 3147912

5.

Globalni transkriptomski odziv bakterije Escherichia coli na bakteriocin kolicin M.

Transkriptomska analiza je razkrila, da izpostavljanje subinhibitornim koncentracijam kolicina M vpliva na izražanje genov vpletenih pri odzivu na stres ovoja in druge oblika stresa vkjlučno z geni dvokomponentnega sistema CreBC, produkcijo eksopolisaharidov in celične gibljivosti. Vendar, kolicin M ni induciral tvorbo biofilma ali genov vpletenih v mutagenezi. Naši izsledki potrjujejo potencial kolicina M oz. njegove katalitične domene za razvoj učinkovitega in varnega protimikrobnega sredstva.

COBISS.SI-ID: 2748239