J7-4050 — Letno poročilo 2011
1.
Razpotje med mehanizmom zvijanja in agregacije proteinov

Povezali smo spektroskopska merjenja zvijanja pri nevtralnem ali rahlo kislem pH-ju s začetkom rasti fibril. Ugotovili smo, da pri wt proteinu fibrili nastajajo iz delno zvitega intermediata.

COBISS.SI-ID: 25224231
2.
Modulacija efekta urejanja stranskih verig pri dvo-stopenjskem zvijanju stefinov A in B

Na modelu obeh stefinov smo primerjali različne modele za zvijanje proteinov, med njimi model urejanja (contact order) in pa model ogrodja (framework). Ugotovili smo, da pri stefinih velja nek model, ki ni povsem v skladu ne z enim ne z drugim, ampak je kombinacija obeh.

COBISS.SI-ID: 24679719
3.
Mehanizem amiloidne fibrilacije

V tem preglednem članku smo opisali in po svoji presoji razvrstili obstoječe modele za mehanizem nastajanja amiloidnih fibril, s poudarkom na prepletanju domen.

COBISS.SI-ID: 24680231