Namen raziskave je bil določiti proteinske lise v listih sort Starozagorski čern in Tiber, ki se različno izražajo v pogojih sušnega stresa glede na kontrolne pogoje. S pomočjo dvodimenzionalne gelske elektroforeze (2-DE) smo ločili diferencialno fluorescentno označene proteine rastlin, podvrženih stresu in kontrolnih rastlin. Na podlagi proteinskih lis, ločenih z 2-DE, smo s pomočjo programa Progenesis SameSpot ter s statistično analizo regresije na osnovi vsote najmanjših kvadratov določili proteinske točke za nadaljnjo analizo z masno spektroskopijo.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 3921000Aquaporini so beljakovine v celičnih membranah, ki so vpletene v procese vodnega transporta in se diferencialno izražajo v suši. Imajo regulacijske lastnosti in več integriranih funkcij v rasti rastlin, njihovem razvoju in prilagajanju okoljskemu stresu, kot so slana tla in suša. S PCR pristopom smo klonirali več aquaporinskih zaporedij iz genoma fižola, ki so bili dolgi cca. 500 - 1000 nukleotidov. S primerjavo nukleotidov s predhodno identificiranimi rastlinskimi aquaporini, s pomočjo BLAST algoritmov in BLAST iskalnim orodjem, smo jih uspešno opredelilo kot člane PIP in TIP, ki imajo ohranjene motive (npr. NPA box). Filogenetske analize so pokazale manj kot 24% podobnosti med poddružinama PIP in TIP in drugimi skupinami znotraj poddružin. Raznolikost aminokislin aquaporin genom podobnih sekvenc fižola je bila višja znotraj skupine PIP. V tej študiji smo okarakterizirali nove aquaporinske genom podobne sekvence fižola, ki so pomembne za razvoj markerjev, kot pomoč pri žlahtnjenju fižola odpornega na sušo.
F.02 Pridobitev novih znanstvenih spoznanj
COBISS.SI-ID: 3919976