L4-3642 — Letno poročilo 2011
1.
MPIC: Analitična metoda visoke zmogljivosti za sočasno detekcijo DNK tarč

Opisujemo razvoj novega kombiniranega pristopa visoke zmogljivosti za hkratne analize DNK tarč, ki sloni na sočasnem mikrokapljičnem PCR z uporabo kapilarne gelske elektroforeze (MPIC), kar predstavlja dvostopenjsko strategijo PCR pomnoževanja. Ob uporabi genetsko modificiranih organizmov kot modela je bila ugotovljena zmožnost sočasne detekcije 24 DNK tarč z relativno mejo detekcije 0,1% (w/w) in absolutno mejo detekcije 39 DNK tarč. Opisani sistem predstavlja obetavno alternativo za visoko zmogljive anlize več hkratnih DNK tarč.

COBISS.SI-ID: 2345551
2.
Dinamike odgovorov v kompatiblni interakciji med krompirjem in krompirjevim virusom Y so modulirane preko salicilne kisline

Z namenom ugotavljanja dinamike kompatibilne interakcije krompirja s krompirjevim virusom Y (PVY) v odvisnosti od salicilne kisline smo za poskuse uporabili netransgenski kultivar krompirja Désirée, transgenski NahG-Désirée, kultivar Igor in PVYNTN, ki je najbolj agresiven sev PVY. Potrjen je bil pomen salicilne kisline pri pomnoževanju virusa in razvoju simptomov. Pomnoževanju virusa smo sledili z uporabo kvantitativnega PCR, prav tako pa smo s to metodo sledili odgovoru rastline preko izražanja izbranih označevalnih genov fotosintetske aktivnosti, metabolizma ogljikovih hidratov in obrambnega odziva. Razlika v vzorcu izražanja genov med dvema občutljivima genotipoma kaže, da se rezultat interakcije ne opira le na eno regulatorno komponento, temveč da so podobne fenotipske lastnosti rezultat različnih odgovorov na molekularnem nivoju.

COBISS.SI-ID: 2492751