1.

Uropatogeni specifični protein Usp je bakteriocinu podoben genotoxin

Protein Usp, je virulentni dejavnik, ki inducira poškodbe genoma, prerazporeditve citoskeleta in apoptozo celic humanih celičnih linij. Usp je izločen iz bakterijskih celic. Zaradi genotoksične aktivnosti bi Usp lahko bil vpleten tudi pri kroničnih vnetnih bolezni prebavnega trakta in nastanku rakastih bolezni.

COBISS.SI-ID: 2871119

2.

Protein Imu3 sevov bakterije Escherichia coli, ki producirajo Usp izkazuje sposobnost vezave nukleinskih kislin.

Proteini Imu1-3 bakterije E. coli, ki producirajo Usp ščitijo producenta pred nukleazno aktivnostjo slednjega. Za optimalno zaščito so potrebni vsi trije proteini Imu, vendar nobeden ne tvori kompleksa s proteinom Usp. Imu3 ščiti genom producenta z nespecifično vezavo na DNA.

COBISS.SI-ID: 3037263

3.

Popravljanje poškodb DNA in bakterijski patogeni

Vsi organizmi imajo mehanizme za popravljanje poškodovane DNA. Eden najpomembnejših mehanizmov bakterij je odziv SOS. Kljub temu, da odziv SOS popravlja poškodbe, v kolikor so te obsežne odziv sproži mutagenezo, ki pospeši porajanje in širjenje odpornosti proti antibiotikom in virulentnih dejavnikov. Na drugi strani bakterije z indukcijo vnetnih odziv in produkcijo genotoksinov kot je Usp tudi poškodujejo genom človeka in živali kar lahko privede do rakastih obolenj.

COBISS.SI-ID: 2968911

4.

Prevalenca in povezave tcpC, z zapisom za protein z domeno vezave Toll/Interlevkina-1 med sevi Escherichia coli izoiranih iz okužb urinarnega trakta, okužb kože in mehkih tkiv ter komenzalnimi izolati.

TcpC, novo odkriti protein z domeno vezave Toll/Interlevkina-1 uropatogenih sevov Escherichia coli je vpleten pri supresiji naravne imunosti. Prevalenca tcpC in njegova povezanost z dejavniki virulence ter filogenetskimi skupinami je bila preučena med 212 sevov E. coli iz okužb urinarnega trakta (UTI) ter okužb kože ter mehkih tkiv (SSTI) kakor tudi med 90. komenzalnimi sevi. Prevalenca tcpC je bila pri sevih UTI 21% pri sevih SSTI 25%, medtem ko je bila pri komenzalnih sevih 8%. Statistično značilne asociacije so bile ugotovljene med tcpC ter cnf, hlyA in usp.

COBISS.SI-ID: 2164303

5.

Interkonverzija med vezano in prosto konformacijo proteina LexA uravnava SOS odziv bakterij

Fleksibilnost konformacije nevezanega proteina LexA je ključni element vzpostavitve usklajenega odziva SOS. medtem ko LexA izkazuje različne hitrosti disociacije iz operatorjev genov, interagira izredno hitro z DNA tarčnih zaporedij. Modifikacije aktivnosti LexA vpliva na pojav perzisterjev, ki tolerirajo antibiotike v populacijah bakterij.

COBISS.SI-ID: 2368847