1.

Vloga kolicinov bakterije Escherichia coli in izražanje genov za njihovo sintezo

Z namenom pridobiti vpogled v odziv občutljivih bakterijskih populacij na kolicin M v naravnem okolju, kakor tudi ob uporabi kolicina kot protimikrobnega sredstva, smo preučevali odziv seva E. coli na subinhibitorne koncentracije ColM s transkriptomsko analizo celotnega genoma z DNA mikromrežami in z uporabo fizioloških testov. Transkriptomska analiza je pokazala povečanje izražanja genov stresnih odzivov ovojnice, osmotskih in drugih vključno z geni dvokomponentnega sistema CreBC, geni za sintezo zunajceličnih polisaharidov in zmanjšano izražanje genov za gibljivost. Preučeno je bilo tudi izražanje gena cka za kolicin K in ugotovljeno, da pri uravnavanju izražanja, protein IscR stabilizira protein LexA na promotor in skupaj s kooperativnostjo vezave dveh LexA dimerov povzroči zamik v transkripciji po indukciji odziva SOS.

D.09 Mentorstvo doktorandom

COBISS.SI-ID: 773239

2.

Dejavniki virulence uroseptičnih sevov Escherichia coli ter možnost uporabe kolicinov - novih protimikrobnih snovi v boju proti okužbam urinarnega trakta

Izolati, ki so bili uvrščeni v filogenetsko skupino B2 so imeli bistveno večji nabor dejavnikov virulence, vključno z genom usp, kot izolati iz ostalih skupin. Kolicini E6, E7, K in M so učinkovito inhibirali rast uroseptičnih izolatov E. coli. Najučinkovitejši je bil kolicin E7, saj je inhibiral rast kar 87% preiskovanih izolatov. Z ustrezno kombinacijo kolicinov je bilo mogoče preprečiti rast kar 98% preiskovanih izolatov.

D.09 Mentorstvo doktorandom

COBISS.SI-ID: 739959

3.

Sev ŽP bakterije Escherichia coli in nov mehanizem protimikrobnega delovanja

Sev ŽP je modificiran probiotični sev Nissle z zapisom za sintezo bakteriocina E7 na konjugativnem plazmidu in zapisom za imunost proti bakteriocinu E7 v kromosomu. Kolicin uniči patogene seve bakterije E. coli po konjugativnem prenosu plazmida. Opisani sev se izogne odpornosti proti protimikrobni učinkovini.

F.33 Patent v Sloveniji

COBISS.SI-ID: 2853455

4.

Bakterij ne bomo prelisičili, pojavljali se bodo novi izbruhi

Leta 2011 je v Nemčiji in drugih državah Evrope umrlo 40 oseb zaradi izbruha enterohemoragične Escherichia coli. Vir okužbe so bili kalčki uvoženi iz Egipta. Sev so uvrstili v patotip enteroagregativne E. coli, ki je horizontalnim prenosom DNA pridobil zapis za sintezo Šiga toksina.

F.35 Drugo

COBISS.SI-ID: 258514176

5.

Mikrob in patogeneza

Učbenik za predmet Mikrob in patogeneza

D.10 Pedagoško delo

COBISS.SI-ID: 2965583