S študijo smo objavili se neopisane gene, ki so vpleteni v razvoj pljučnega raka. Z uporabo DNA mikromrež smo identificirali prekomerno izražene in utišane gene pri pljučnih tumorjih. Naše odkritje je potrdilo tumor-supresorsko vlogo gena VIPR1 v pljučni tumorigenezi, ter povezalo izgube kromosoma na mestu 3p22 kot mehanizem utišanja VIPR1 pri pljučnih tumorjih.
COBISS.SI-ID: 26449625
Z verižno reakcijo prepisovanja v realnem času (RT-PCR) smo analizirali izražanje genov COX-2, hTERT, MDM2, LATS2 in S100A2 in iskali zveze med pljučnimi tumorji in razlikami v izražanju genov. Razlike v izražanju LATS2, S100A2, MDM2 in hTERT so značilne za določen tip tumorjev. S študijo smo odkrili značilne vzorce izražanja genov pri različnih tipih nedrobnoceličnih pljučnih tumorjev, ki lahko vplivajo na rezultate analiz, če vzorci niso histološko opredeljeni in nove povezave med stopnjo izražanja raziskovanih genov in specifičnimi tipi pljučnih tumorjev.
COBISS.SI-ID: 25342937
LATS2 je nov član družine tumor supresorjev LATS2. LATS2 gen se nahaja na kromosomu 13q11-12, ki je znano mesto (67%) izgube heterozigotnosti (LOH) v nedrobnoceličnim rakom pljuč. V študiji smo objavili izsledke analize LATS2, P53 in K-RAS genov v 129 NSCLC tumorjih in 13 celičnih linij, ki izhajajo iz pljučnih tumorjev. Pri preko 50% vzorcev smo odkrili mutacije ali polimorfizme v najmanj enem genu, prav tako smo odkrili še neobjavljene mutacije v LATS2 (S1073R in izgubo PAPA- ponovitev), ki so sporadične in značilne le za pljučne tumorje. Prav tako smo opazili znižanje izražanja gena LATS2, ki pa ni bilo povezano z odkritimi mutacijami, in da imajo tumorji z mutacijami pogoste mutacije tudi v LATS2, kar pomeni, da so mutacije v LATS2 poznejši dogodek v tumorigenezi pljučnega raka.
COBISS.SI-ID: 25008601