J4-2228 — Letno poročilo 2010
1.
Iskanje znanja v omskih podatkih s pomočjo novih algoritmov podatkovnega rudarjenja

Razvili smo novo metodo podatkovnega rudarjenja RelSets, ki se je izkazala za dopolnilno analizno orodje podatkov DNA-mikromrež. Z njeno uporabo poiščemo gene, ki determinirajo skupino vzorcev medtem, ko z standardnimi statistčnimi modeli poičemo gene, ki dobro ločujejo med večimi skupinami vzorcev.

COBISS.SI-ID: 2210383
2.
Transkriptomske analize interakcij krompir-PVY

V okviru tega dela smo proučevali odgovore rastline na napad patogena na nivoju izražanja genov. Uporabljali smo tako DNA mikromreže kot tudi kvantitativni PCR v realnem času. Rezultati so nam dali boljši vpogled v fiziologijo interakcije krompirja z biotrofičnim patogenom virusom PVYNTN. S tem delom smo dobili nove informacije o fiziologiji odziva rastline po napadu različno agresivnih virusnih različkov.

COBISS.SI-ID: 2254415