J4-2195 — Letno poročilo 2009
1.
Regulatorni elementi v genski skupinah tetraciklinskih antibiotikov

Izražanje poliketidnih genskih skupin pogosto regulirajo različne družine regulatornih proteinov. V članku smo izvedli primerjalno bioinformatsko analizo regulatornih genov, ki se nahajajo v oksitetraciklinski genski skupini v Streptomyces rimosus in klortetraciklinski genski skupini v S. aureofaciens. Identificirali smo nov regulatorni gen otcG iz družine LAL(luxR), ki ni prisoten v genski skupini za klortetraciklin. Z eksperimenti prekinitve in povečanim izražanjem otcG gena smo pokazali, da ima pozitivno vlogo pri biosintezi oksitetraciklina.

COBISS.SI-ID: 3608696
2.
Primerjava proteomov dveh patotipov glive Verticillium albo-atrum iz hmelja

Dva različna patotipa glive Verticillium albo-atrum sta bila analizirana z uporabo proteomskega pristopa, vključujoč 2-D elektroforezo za ločevanje proteinov, obdelavo slik gelov z računalniškim programom in identifikacijo različno izraženih proteinov s tandemsko masno spektrometrijo. Določene metode, ki so bile razvite v okviru tega članka, bomo uporabili tudi tekom raziskovalnega projekta.

COBISS.SI-ID: 5973881