MicroRNAs (miRNAs) so razred malih nekodirajočih RNA, ki, pri evkariontih delujejo v utišanju izražanja genov. miRNA v kompleksu s partnerskimi proteini pripelje do razgradnje ali utišanja tarčne mRNA. Bioinformatske napovedi in rezultati laboratorijskih raziskav kažejo, da miRNA nadzirajo izražanje precejšnjega deleža beljakovin, kar pomeni, da miRNA sodelujejo pri uravnavanju večine bioloških procesov. V tem preglednem članku smo opisali bioložke lasntosti miRNA, ter predstavili primere manipulacije njihovega izražanja v smeri celičnega inžineringa ali razvoja terapij.
COBISS.SI-ID: 3197041
Male nukleolarne RNA (snoRNAs) sestavljajo skupino nekodirajočih RNA, ki so vključene v posttranskripcijske spremembe ribosomskih (rRNA) in malih jedrnih RNA (snRNA). Vendar pa so pred kratkim odkrili številne tkivno specifične snoRNAs, ki ne vežejo rRNA in snRNA. Te ‘netipične’ snoRNA lahko vplivajo na modifikacijo mRNA in s tem na prepisovnje mRNA v proteine. V tem preglednem članku smo opisali biogenezo snoRNA in v luči nedavnih zanimivih odkritij razširili opis njihovih funkcij. Prav tako smo razpravljali o možnosti rekombinantnih snoRNAs, ki se uporabljajo v uravnavanju izražanja genov.
COBISS.SI-ID: 24989735
Ugotovili smo pot vnosa TDP-43 v jedro s pomočjo karioferina beta 1. Zmanjšanje izražanja jedrnih transportnih proteinov, ki so v kaskadi karioferina beta 1, povzroči kopičenje TDP-43 v citoplazmi. Pri pregledu izražanja jedrnih transportnih proteinov v tkivih pacientov z FTLD smo ugotovili, da je izražanje proteina CAS (cell apoptosis susceptibility protein) bistveno manjše, kar lahko vpliva na kopičenje TDP-43 v citoplazmi. Ta ugotovitev nakazuje, da so motnje v jedrskem transportu TDP-43 eden od temeljnih vzrokov za proteinopatije TDP-43.
COBISS.SI-ID: 23645223
V tem članku smo ugotovaljal povezanosti inkluzij proteina optinevrina z različnimi nevrodegenerativnimi boleznimi, vključno s PB. Z imunohistokemijskimi in biokemijskimi metodami smo ugotovil, da so inkluzije optineurina pojavljajo v manjšem deležu ALS in FTLD-TDP primerov ter da se le redko pojavljajo v drugih nevrodegenerativnih boleznih.
COBISS.SI-ID: 24751911
Pri nevrodegeneraciji je starost oziroma staranje najpomembnejši dejavnik tveganja, vendar pa se vpliv staranja ali nevrodegeneracije na izražanje genov v človeških možganih najpogosteje študira ločeno. V tem članku smo analizirali spremembe v nivoju transkripcije in alternativnega spajanja v temporalnem korteksu posameznikov različnih starosti, ki so bili kognitivno normalni ali prizadeti s frontotemporalno lobarno degeneracijo (FTLD) ali Alzheimerjevo bolezenijo (AD). Pri kognitivno normalnih posameznikih smo ugotovili s starostjo povezane spremembe v alternativnem spajanju ter, da so enake spremembe pojavljajo pri 95 odstotkih posameznikov z FTLD ali AD, neodvisno od njihove starosti. Te spremembe so v skladu s povečanim alternativnim spajanjem, odvisnim od proteina PTB (polypyrimidine trakt binding protein). Ugotovili smo tudi bolezensko specifične spremembe alternativnega spajanja, ki so bile prisotne pri osebah z FTLD ali AD, vendar ne v kognitivno normalnih posameznikih. Te spremembe so se skladale z zmanjšano regulacijo alternativnega spajanja s proteinom NOVA (nevro-onkološko ventralni antigen), ki je tudi imel zmanjšano izražanje v jedrih. Dramatično zmanjšanje izražanja nevronskih genov je povezano z boleznijo medtem, ko je pri staranju je opaženo skromno zmanjšanje izražanja glialnih in nevronskih genov. Čeprav naši podatki kažejo, da se s starostjo povezane spremembe alternativnega spajanja uravnavajo neodvisno od sprememb na nivoju transkriptoma, se njun vpliv opazi na izražanju genov s podobnimi funkcijami, kot na primer genov presnove ali popravljanja DNA. V tej raziskavi ugotovljene spremembe alternativnega spajanja opisujejo novo zvezo med staranjem in nevrodegeneracijo.
COBISS.SI-ID: 8549204