J2-2131 — Letno poročilo 2010
1.
De novo načrtovanje ortogonalnih peptidnih parov, ki tvorijo paralelne heterodimerne ovite vijačnice

Načrtovali in testirali smo set parov peptidov, ki tvorijo paralelno ovito vijačnico. Načrtovanje temelji na izračunu maksimalne razlike med stabilnostjo željenega para in najstabilnejšega neželjenega para. Uporabili smo N-terminalni segment za inicializacijo heliksa, favorizirane kombinacije aminokislin za elektrostatske in hidrofobne interakcije, in negativni dizajn, ki temelji na principu zakopanih Asn preostankov. S CD smo analizirali 36 možnih kombinacij med osmimi peptidi. Le kombinacije željenih parov so tvorile alfa-helikalne strukture, kar potrjuje ortogonalnost seta peptidnih parov.

COBISS.SI-ID: 4534810
2.
Funkcionalizacija trdnih površin s kovalentno vezavo bioaktivnih peptidov

Študirali smo možnost funkcionalizacije površin z bioaktivnimi peptidi za uporabo v medicini. Na modelnem substratu smo pripravili površinsko prevleko, na katero smo vezali modelni peptid z antibiotično aktivnostjo. Tako pripravljena površina je izkazovala biocidno aktivnost, saj je znižala koncentracijo Gram-negativne bakterije E. coli za več kot pet velikostnih redov. Površinske prevleke z antimikrobno aktivnostjo so potencialno uporabne za medicinske naprave, kot so katetri in implantati, za preprečitev tvorbe mikrobnega biofilma, ki vodi do težko ozdravljivih infekcij.

COBISS.SI-ID: 4471578