P4-0116 — Letno poročilo 2013
1.
Mreženje in plastičnost mikrobnih združb

Vodja programske skupina Prof. dr. Ines Mandić Mulec je predsedovala znanstvenemu odboru in tudi organizacijskemu odboru 12. mednarodnega kongresa BAGECO (Bacterial genetics and Ecology), ki je potekal letos junija v Ljubljani v hotelu Union. Naslov mednarodnega srečanja “Networking and plasticity of microbial communities: the secret to success” je skladen z enim od temeljnih področij dela programske skupine. BAGECO je napomembnejši evropski kongres s področja mikrobne ekologije in genetike, ki poteka vsaki dve leti in se ga udeleži največ 300 raziskovalcev. Je kongres, ki odpira nove koncepte na področju ekologije mikroorganizmov in povabilo k organizaciji in predsedovanju tega kongresa je izredna čast, ki kaže na uveljavljenost vodje programa na področju mikrobne ekologije. Kongresa (podrobnosti dostopne na strani http://www.bageco2013.org ) se je letos udeležilo več kot 300 raziskovalcev iz 50 držav sveta. Svoje dosežke in kritične poglede je predstavilo 13 svetovno priznanih vabljenih predavateljev. Kongres je bil izredno uspešen in je domačim raziskovalcem odprl vrata za številne sodelave s svetovno priznanimi raziskovalnimi skupinami.

B.01 Organizator znanstvenega srečanja

COBISS.SI-ID: 4259448
2.
Poročilo o monitoringu depozitorija arheološkega mokrega lesa v obdobju od marca do avgusta 2013

Uporaba naravoslovnih pristopov pri proučevanju kulturne dediščine nacionalnega pomena postaja vse bolj pomembna pri odločitvah v konzervatorski stroki. V tem delu smo proučevali okoljske in mikrobiološke parametre, ki vplivajo na mikrobiološko vodeno razgradnjo arheološkega lesa. Spremljali smo 15 fizikalno-kemijskih in mikrobioloških parametrov v depozitoriju arheološkega mokrega lesa v opuščenih glinokopih na Ljubljanskem barju v rednih dvotedenskih vzorčenjih. Pokazali smo, da oligotrofno aerobno okolje depozitorija omogoča počasno biorazgradnjo arheološkega lesa.

D.11 Drugo

COBISS.SI-ID: 4294776
3.
Mehanizem mikrobne odpornosti v biofilmu

Podali smo pregled o mehanizmih odpornosti na okoljske stresne pogoje, ki so odvisni od strategij posameznih mikroorganizmov ali njihovih združb in vplivajo na fiziološko ter genetsko raznolikost mikrobnih biofilmov. Njihovo poznavanje lahko izboljša biotehnološko aplikacijo in izboljša mikrobiološko varnost med živilsko proizvodno verigo.

D.11 Drugo

COBISS.SI-ID: 4286584
4.
Geni za biosintezo tetraciklinskih molekul in njihova uporaba

V letu 2013 je bil podeljen ameriški patent US 8361777 B2 za izum, ki na podlagi novo odkrite genske skupine za biosintezo nenevadnega tetraciklinskega antibiotika kelokardina omogoča pridobivanje novih biološko aktivnih tetraciklinskih struktur z biosinteznim inženirstvom in polsintezno kemijo. Na ta način pridobljeni novi antibiotiki delujejo na številne patogene organizme v izredno nizkih koncentracijah in kažejo netipičen mehanizem delovanja, kar je ključnega pomena pri razvoju novih zdravil proti bakterijskim infekcijam, ki jih povzročajo patogeni sevi, rezistentni antibiotike, ki so trenutno v klinični praksi. Poleg izjemnega znanstvenega pomena ima nova platforma za razvoj antibiotikov skupaj z v letu 2013 podeljenim patentom potencialno tudi velik aplikativni in komercialni pomen in predstavlja tudi temelj za sodelovanje z akademskimi organizaciji in podjetji, ki se osredotočajo na razvoj novih zdravil.

F.06 Razvoj novega izdelka

COBISS.SI-ID: 4250744
5.
Vrednotenje raznolikosti mlečnokislinskih bakterij in kvasovk v tradicionalnih belih slanih in svežih mehkih sirih iz goratih predelov Srbije in nižinskih območjih Hrvaške.

Namen študije je bila izolacija, identifikacija in karakterizacija avtohtonih mlečno-kislinskih bakterij in kvasovk izoliranih iz 18-ih tradicionalnih sirov regij na Zahodnem Balkanu. V teh sirih je bila značilna velika vrstna raznolikost (povprečni H’MKB = 0.4 in H’Kv = 0.8). Prevladujoče vrste mlečno-kislinskih bakterij (MKB) v srbskih sirih so bile: Lactococcus lactis, Lactobacillus plantarum in Leuconostoc mesenteroides, v hrvaških sirih Lactococcus lactis, Enterococcus faecalis in Leuconostoc pseudomesenteroides. Izmed 20 vrst kvasovk so prevladovale vrste Debaryomyces hansenii, Candida zeylanoides in Torulaspora delbrueckii v srbskih sirih, medtem ko je vrsta Yarrowia lipolytica prevladovala v hrvaških sirih. Karakterizacija njihovih metabolnih in tehnoloških lastnosti je pokazala, da je 53,4 % MKB proizvajalo protimikrobne snovi, 44,3 % MKB je imelo proteolitično aktivnost, na drugi strani je večina kvasovk imela tako lipolitično kot proteolitično aktivnost. Rezultati so pokazali, da je vrstna sestava populacij geografsko specifična in da bi bilo potrebno v industrijski proizvodnji regionalno značilnih sirov uporabiti avtohtone vrste/seve.

D.11 Drugo

COBISS.SI-ID: 4256888