Pokazali smo, da elektroforetski nizkonapetostni pulzi povečajo učinkovitost genske elektrotransfekcije pri nizki koncentraciji plazmida in/ali kadar je mobilnost DNA omejena (npr. in vivo zaradi zunajceličnega matriksa), pri višjih koncentracijah plazmida, kakršne se tipično uporabljajo in vitro, pa nizkonapetostni pulzi ne igrajo pomembnejše vloge.
COBISS.SI-ID: 6679380
Ovrednotili smo obstojnost kompleksa DNA/celična membrana, ki je ključen za uspešno gensko elektrotransfekcijo. Rezultati kažejo, da je kompleks DNA/celična membrana najprej metastabilen. V tej fazi se DNA lahko sprosti v nazaj v medij, kar smo dokazali z dovajanjem pulzov nasprotnih polaritet s ponavljalno frekvenco pod 1 Hz. Metastabilni kompleks nato preide v stabilnega, iz katerega molekule DNA ni več mogoče odstraniti. Ovrednotili smo življensko dobo metastabilnega kompleksa, ki znaša približno 1s, kar pripomore k optimizaciji protokolov elektrogenske transfekcije.
COBISS.SI-ID: 7524436
Razvili in zgradili smo generator električnih visokonapetostnih pulzov, ki temelji na Blumleinovem principu generiranja pulzov, a poleg unipolarnih omogoča tudi generiranje bipolarnih pulzov s ponavljalno frekvenco do 1.1 MHz. Generator je uspešno prestal testiranje in izkazal svojo uporabnost v eksperimentalnem delu. Fleksibilnost generatorja bo omogočila učinkovite raziskave vloge ponavljalne frekvence in polaritete pulzov pri permeabilizaciji tako zunanje celične kot notranjih organelnih membran.
COBISS.SI-ID: 7346772
Razvili smo model zbiranja podatkov kliničnih študij na papirju (PDC) in v elektronski obliki (EDC), model pa smo uporabili za analizo stroškovnih razlik med obema procesoma. Identificirali smo podprocese ki najbolj vplivajo na trajanje in stroške zbiranja podatkov, največje razlike med procesoma pa so v podprocesu upravljanja s podatki. Za klinično študijo, ki smo jo v naši simulaciji preučili najpodrobneje, smo ocenili, da uporaba EDC zniža stroške zbiranja podatkov za 55%, za različne druge scenarije pa so bili prihranki v primerjavi s PDC v razponu med 49% in 62%.
COBISS.SI-ID: 7082836
Razvili smo dinamičen numerični model, ki temelji na metodi končnih elementov in omogoča simulacijo izgradnje vsiljene membranske napetosti in elektroporacije membrane, ki jo ta povzroči. Ta dinamični model upošteva, da je prevodnost membrane funkcija tako časa kot vsiljene napetosti, napovedi modela pa so v primerjavi z obstoječimi stacionarnimi modeli bistveno bolj realistične, vključno z natančnejšo predikcijo velikosti in lege poriranih področij membrane. Dodatna prednost našega pristopa je možnost neposredne primerjave med izračuni in poizkusi, saj je mogoče oboje izvesti na isti celici.
COBISS.SI-ID: 7101524