1.

Metoda za kategorizacijo zveznih atributov

Članek opisuje postopek, s katerim lahko poiščemo prag - vrednost zveznega atributa -, ki optimalno razdeli primere v dve podmnožici, pri čemer je optimalnost določena z mero, ki ne sešteva prek posamičnih primerov (kot npr. entropija), temveč prek parov primerov. Algoritem zmanjša kvadratno časovno kompleksnost, ki bi jo dala metoda grobe sile, v linearno. Obenem smo razvili tudi podoben algoritem za razdelitev vrednosti diskretnih atributov v podmnožice.

COBISS.SI-ID: 7550548

2.

Razlaga klasifikacije primerov z interakcijami podmnožic vrednosti atributov

V članku sta opisana razviti formalizem in metodologija za razlago posameznih klasifikacij za poljuben model. Formalizem temelji na interakciji vsake izmed podmnožic vrednosti atributov. Empirično ovrednotenje potrjuje uporabnost in intuitivnost razlage.

COBISS.SI-ID: 7252308

3.

Primerjava pristopov za ocenjevanje zanesljivosti posameznih regresijskih napovedi

V članku primerjamo različne pristope k ocenjevanju zanesljivosti posameznih regresijskih napovedi. S kombiniranjem parov posameznih ocen predlagamo novo oceno, ki točneje ocenjuje zanesljivost posameznih napovedi od ostalih ocen. Rezultati so pokazali smotrnost uporabe ocen, zasnovanih na analizi občutljivosti, ter ocen, ki temeljijo na pristopu bagging, zlasti v kombinaciji z nevronskimi mrežami, pristopom bagging in lokalno uteženo regresijo.

COBISS.SI-ID: 6923604

4.

Interaktivna spletna aplikacija za analitiko genskih podatkov o amebi D. discoideum

Razvili smo interaktivno spletno aplikacijo imenovano dictyExpress (www.ailab.si/dictyexpress), ki uporabniku na enostaven način ponuja sicer rezultate kompleksnejših analiz transktiptomskih podatkov o mutantih socialne amebe D. discoideum. Razvite metode in aplikacija so plod sodelovanja z raziskovalci iz Baylor College of Medicine. Na aplikacijo kažejo direktne povezave iz spletne strani tega organizma (www.dictybase.org) in je od oktobra 2009 v stalni uporabi s strani raziskovalcev tega organizma.

COBISS.SI-ID: 7219028

5.

Preverjanje uporabnosti iskanja SNP interakcij z razdeljevanje podatkov na podenote

Ob iskanju interakcij med enojnimi nukleotidnimi polimorfizmi (SNP) smo soočeni s poplavo hipotez. Ker je nadaljnje testiranje drago, želimo zmanjšati delež napačno pozitivno ocenjenih hipotez. Preizkusili smo že objavljeno metodologijo (Gayan et al., 2008) za zmanjševanje števila napačno pozitivnih hipotez. V nasprotju z izvirno objavo metodologije smo ugotovili, da se s tem rezultati le poslabšajo, in to tudi utemeljili. Vzpostavili smo okolje za primerjavo metod za iskanje SNP interakcij, ki bo uporabno tudi za nove raziskave.

COBISS.SI-ID: 7553364