P1-0242 — Letno poročilo 2009
1.
Načrtovanje topologije G-kvadrupleksov s kontrolo orientacije okoli glikozidne vezi

S pomočjo analize razporejenosti sin in anti gvaninskih preostankov vzdolž skeleta poznanih struktur G-kvadrupleksov smo razvili metodologijo, ki omogoča načrtovanje želene topologije G-kvadrupleksa. Do sedaj je bilo odkritje novega zvitja naključno. Za programirano tvorbo objektov in nano-napravic na osnovi DNK pa želimo sistematizirati principe, ki predstavljajo osnovo procesa zvijanja in omogočajo racionalno napoved. Napoved zvitja v predvideno topologijo smo eksperimentalno verificirali in potrdili s sintezo oligonukleotida, ki smo mu določili 3D strukturo z uporabo NMR v raztopini.

COBISS.SI-ID: 4320026
2.
DiPAMP-ov "Big Brother i-Pr-SMS-Phos" kaže izjemne značilnosti izboljšujoč rodij (I)-katalizirano hidrogeniranje olefinov

Pripravili smo nov P-stereogen 1,2-bis[(o-iso-propoksifenil)(fenil)fosfino] etanski ligand (i-Pr-SMS-Phos) in ga preizkusili v Rh-kataliziranem asimetričnem hidrogeniranju olefinov. Študirali smo tudi katalitski profil Rh-(iPr-SMS-Phos)-a pod različnimi reakcijskimi pogoji. NMR študije hidrogeniranja MAC-a s tem katalizatorjem so prvič pokazale, da se bolj reaktiven katalizator-substrat adukt tvori v večjem deležu kot manj reaktiven adukt, kar je v nasprotju z običajnim trendom pri tovrstni katalizi, kar rezultira v večji doseženi reakcijski hitrosti in enantioselektivnosti.

COBISS.SI-ID: 4320282
3.
Strukturni efekti zamenjave mostu Cis-S-S-Cis s His-Me(II)-His.

Zamenjava mostu Cis-S-S-Cis s His-Me(II)-His je zelo obetavna, saj posledični kompleksi ohranijo topološko podobnost z naravnim S-S premostitvenim AVP in OXT pri pH vrednostih, ki ustrezajo fiziološkim pH. Poročali smo o podrobnih potenciometričnih in spektroskopskih študijah o Cu(II) kompleksih s [His(1,6)]OXT, skupaj z visoko ločljivostjo 3D struktur Cu(II) kompleksov s [His(1,6)]OXT in [His(1,6)]AVP analogi.

COBISS.SI-ID: 4171546
4.
Konformacijska študija 2,7-disubstitutiranih-indolov ob interakcijah z anioni

Z uporabo NMR smo študirali konformacijsko predorganizacijo in z vezavo anionov povezane konformacijske spremembe indolov, ki so substituirani z amidno skupino na mestu 2 in različnimi amidnimi, ureidnimi in tioureidnimi skupinami na mestu 7. NOE eksperimenti so pokazali na preferenco za anti–anti orientacijo okoli C2–C2a in C7–N7a vezi v receptorjih v odsotnosti anionov. NOE ojačitve v prisotnosti anionov so pokazale, da kompleksi anion–receptor favorizirajo sin–sin konformacijo C2 in C7 substituent.

COBISS.SI-ID: 4211482
5.
Histidinski analogi oksitocina in vazopresina so učinkoviti ligandi za Zn(2 +) ione

Interakcijo med Zn(2 +) ioni in histidinskimi analogi oksitocina in arginin-vazopresina smo proučevali s potenciometričnimi metodami za ugotavljanje stehiometrije oblikovanih kompleksov, in izračun njihovih stabilnostnih konstant. NMR meritve so pokazale podrobne strukture kompleksov in potrdile zavezujoči način pri fiziološkem pH.

COBISS.SI-ID: 4178458