P1-0198 — Letno poročilo 2010
1.
Raznolikost mikrobnih združb, ki kolonizirajo stene kraške jame v Sloveniji.

Na podlagi analiz genov za 16S rRNA so bile iz biofilma mikrobnih združb kraške jame določene bakterije iz osmih debel.

COBISS.SI-ID: 2120783
2.
Geni uravnani z represorjem sistema SOS bakterije Escherichia coli izkazujejo heterogeno izražanje.

Izražanje genov recA, lexA in cka odziva SOS bakterije E. coli je bilo proučevano na podlagi fluorescence genskih fuzij z genom gfp za zeleni fluorescirajoči protein. Fluorescentna mikroskopija bakterijskih celic je razkrila, da se geni odziva SOS v populacijah genetsko identičnih celicah izražajo heterogeno.

COBISS.SI-ID: 2304079
3.
Prevalenca in asociacije gena tcpC pri sevih Escherichia coli izoliranih iz okužb urinarnega trakta, okužb kože in mehkega tkiva ter iz komenzalov.

Preučili smo prevalenco gena tcpC, z zapisom za sintezo proteina z Toll/interlevkin – 1 receptorsko domeno vpleteno pri supresiji prirojene imunosti, v zbirki patogenih sevov E. coli in iz 90 komenzalnih sevov E. coli. S statistično analizo smo dokazali, da je gen tcpC bolj prevalenten pri patogenih sevih kot pri komenzalih in, da je povezan s filogenetsko skupino B2 ter z geni za virulentne dejavnike cnf1, hlyA, papGIII, sfaDE in usp.

COBISS.SI-ID: 2164303
4.
pH vpliva na permeabilizirajočo aktivnost perforina človeka ne pa na njegovo vezavo na lipidne membrane.

Površinska plazmonska rezonanca je pokazala, da je tvorbe por perforina človeka odvisna od kalcija in neodvisna od pH. Konformacija perforina je bila ocenjena z monoklonskimi protitelesi.

COBISS.SI-ID: 2243663
5.
Dinamika mikrobnih in virusnih združb v štirih vodnih okoljih.

Proučevanje časovne dinamike klonskih linij Haloquadratum walsbyi, ki naseljujejo slanico solin je razkrila, da se je vrstna sestava in metabolni potencial klonskih linij H. walsbyi in njihovih predatorjev, bakterijskih virusov, ohranjala v času.

COBISS.SI-ID: 2365007