P1-0048 — Letno poročilo 2009
1.
Brlog ligandov: spletni streznik za validacijo geometrije heteromolekul temeljec na podatkovni bazi PURY.

SLO Pred kratkim smo generirali PURY (Andrejašič in sod, 2008) podatkovno bazo geometrijskih podatkov za heteromolekule, ki smo jih izvedli zi struktur deponiranih v kristalografski bazi v Cambridge-u (CSD). Ta spletni vmesnik je bil zdaj razširjen (http://pury.ijs.si/). V novi obliki ponuja orodja, ki poleg generacije topoloških in geometrijskih parametrov, izvajajo tudi validacijo. Programska oprema je bila uporabljena za validacijo hetero struktur že deponiranih v PDB.

E.02 Mednarodne nagrade

COBISS.SI-ID: 000000
2.
Soustanovitelj in partner Centra odličnosti CIPKeBiP, koordinator Dušan Turk

CIPKeBiP povezuje znanje, izkušnje in tehnologije vrhunskih slovenskih raziskovalnih skupin, ki se ukvarjajo z raziskovanjem proteinov ter njihovih lastnosti in funkcij s poudarkom na specifične biološke probleme visoke znanstvene in biomedicinske relevance. Center koordinira Odsek za biokemijo in molekularno ter strukturno biologijo na IJS. V CO sodeluje 5 akademskih in 5 industrijskih skupin in tako pomembno povezuje industrijsko in akademsko sfero.

D.02 Ustanovitev raziskovalnega centra, laboratorija, študija, društva

3.
Infastrukturni center za proizvodnjo in strukturo proteinov.

Organizacija in vodenje centra poteka v okviru raziskovalnih infrastrukturnih centrov Instituta Jozef Stefan (http://www.ijs.si/ijsw/Centri)

D.07 Vodenje centra/laboratorija

4.
Predavanja na mednarodnih konferencah in akademskih institucijah

Vodja skupine in člani so imeli vrsto predavanj po mednarodnih konferencah (Ameriški kristalografski kongres, Central-Eastern European instruct meeting, Združeni kongres Slovenskega biokemijskega društva in Genetskega društva Slovenije z mednarodno udeležbo, Proteinaze in njihovi inhibitorji: nova obzorja, Šesto srečanje mednarodnega društva za proteolizo). na primer [COBISS.SI-ID 22876711] [COBISS.SI-ID 22920743] [COBISS.SI-ID 23564327] [COBISS.SI-ID 22861863] [COBISS.SI-ID 22862375] [COBISS.SI-ID 22862631] [COBISS.SI-ID 23135271]

B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci

5.
Postopki prijavljanja zaprtih sistemov za delo z gensko spremenjenimi organizmi

Slovensko biokemijsko društvo je ustanovilo delovno skupino, ki jo je vodil Marko Dolinar, v njej pa so obravnavali praktične vidike prijavljanja laboratorijev za delo z rekombinantnimi organizmi. Z uveljavitvijo zakonodaje, ki ureja to področje (Zakona o ravnanju z gensko spremenjenimi organizmi in številnih podzakonskih aktov), je bilo treba laboratorije prijaviti pri pristojnem ministrstvu, ob tem pa zagotoviti izdelavo vrste postopkov in internih pravil, ki so bili s strokovnega stališča dokaj zapleteni.

D.11 Drugo

COBISS.SI-ID: 249167872