Predavanje je obsegalo izračuna proste energije v kontekstu molekularnih simulacij. Poleg termodinamskih perturbacij je predavanje vključevalo tudi metode na osnovi kontinuuma in Poisson-Boltzmannove enačbe. Delavnica je potekala v Maleziji in njen namen je bil okrepitev področja načrtovanja zdravil v jugovzhodni Aziji.
D.10 Pedagoško delo
COBISS.SI-ID: 4338458Andrej Perdih je za raziskovalno delo je predstavljeno v njegovi doktorski disertaciji prejel Krkino nagrado. V disertaciji je na osnovi strukturnih podatkov in podatkov kinetičnih študij na primeru ligaze MurD iz E. coli razvil kompleksen dinamični model encima. Izhajajoč iz dostopnih strukturnih podatkov za encima MurD in MurE iz E. coli je identificiral nov razred dualnih inhibitorjev encimov MurD in MurE, ki kot možni nadomestek glutaminske kisline vsebujejo benzen 1,3- dikarboksilatni fragment.
E.01 Domače nagrade
COBISS.SI-ID: 4296986Pokazano je, kako oblikujejo omejitve, ki jih postavlja zahteva po funkcionalnosti na različnih ravneh celičnega delovanja, mutacijske vzorce. Navedeni so primeri omejitev znotraj CpG otokov, eksonov, ponavljajočih se zaporedij in za neselektivni izbor zaporedij.
B.06 Drugo
COBISS.SI-ID: 4299290Predavanje je obsegalo dinamiko reakcij s prenosom protona v majhnih sistemih z vodikovo vezjo in v encimskih centrih. Predstavljen je bil tudi pomen nuklearnih kvantnih efektov pri proženju receptorjev.
B.04 Vabljeno predavanje
COBISS.SI-ID: 4309274Na konferenci, kjer so sodelovali direktorji raziskovalnih enot in vodilni raziskovalci iz največjih svetovnih farmacevtskih hiš, smo predstavili rezultate fragmentnega načrtovanja novih zaviralcev DNA giraz in njihovo potencialno uporabnost kot protimikrobnih učinkovin. Predavanje je vzbudilo precejšen odziv prisotnih.
B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci
COBISS.SI-ID: 4138010