1.

Dokazovanje in opredeljevanje humanih virusov papiloma HPV-6 in HPV-11 z uporabo metode FRET-PCR v realnem času

V ugledni reviji s področja sodobnih viroloških metod smo predstavili originalno različico PCR v realnem času, ki temelji na sistemu hibridizacijskih lovk FRET in s katero je moč v eni sami reakcijski posodici dokazati in opredeliti HPV-6 in HPV-11, kot tudi obe poglavitni skupini podtipskih različic HPV-6 (prototipske in ne-prototipske različice). Metodo odlikuje visoka občutljivost, specifičnost in ponovljivost.

COBISS.SI-ID: 25489881

2.

Razporeditev genotipov humanih virusov papiloma pri bolnicah z rakom materničnega vratu v Sloveniji

V članku smo prvič v Sloveniji na reprezentativnem vzorcu bolnic z rakom materničnega vratu (RMV) (N=287) opredelili zastopanost visokorizičnih genotipov HPV neposredno pred uvedbo profilaktičnega cepljenja proti HPV. Dokazani genotipi (po padajoči pogostnosti) so bili: HPV-16, -18, -33, -45, -31, -51, -58, -59, -35, -52, -73 in -82. Z raziskavo smo dokazali, da bi profilaktično cepljenje proti HPV lahko preprečilo do 77,1% vseh primerov RMV v Sloveniji, ki ju povzročata HPV-16 in HPV-18.

COBISS.SI-ID: 25690841

3.

Primerjava brisov in parnih tkivnih vzorcev raka materničnega vratu za dokazovanje humanih virusov papiloma

V raziskavi smo s primerjavo genotipov HPV, opredeljenih v 40 parnih vzorcih brisov materničnega vratu (MV) in tkivnih tumorskih vzorcev raka materničnega vratu (RMV) odvzetih pri 40 bolnicah z RMV, ugotovili 98,75% celokupno ujemanje. S tem smo dokazali, da je pri ženskah z RMV bris MV enako ustrezen vzorec za določanje genotipov HPV kot tkivni tumorski vzorec. Brise MV lahko zato enakovredno uporabimo za predoperativno diagnostiko in za potrebe raziskav razporeditve genotipov HPV v RMV.

COBISS.SI-ID: 26239449

4.

Genetska raznolikost humanega virusa papiloma genotip 6 (HPV 6)

V raziskavi, ki predstavlja prvo celostno opredelitev podtipskih različic HPV-6, smo s sekveniranjem genomskih področij L1-LCR-E6-E2-E5 77 izolatov HPV-6 iz genitalnih bradavic (GB) in papilomov grla (PG) dokazali 36 genomskih različic HPV-6 od katerih je bilo 6, 1 oz 29 uvrščenih v genetsko družino HPV-6b, -6a oz -6vc. Pri tem smo dokazali številne pomembne mutacije v genomu HPV-6. Dokazali smo tudi, da je bila večina v raziskavo zajetih GB in PG povzročenih z neprototipskimi različicami -6vc.

COBISS.SI-ID: 25836761

5.

Specifičnost testa ''hybrid capture 2 low-risk probe cocktail''

Hybrid Capture 2 low-risk (hc2-LR) je test za dokazovanje 5 klinično najbolj pomembnih nizkorizičnih genotipov HPV: 6, 11, 42, 43, 44. V raziskavi, v katero smo vključili 285 hc2-LR pozitivnih vzorcev, smo z uporabo različnih PCR in genotipizacijo dokazali, da pri tem testu obstaja območje detekcije (siva cona), kjer pogosto prihaja do lažno pozitivnih oz. lažno negativnih rezultatov, in da je v tem primeru potrebno izvesti dodatna testiranja na prisotnost HPV-DNA oz. opredelitev genotipa HPV.

COBISS.SI-ID: 25779929