J3-0612 — Zaključno poročilo
1.
Vloga cisteinskih katepsinov pri procesiranju, aktivaciji in inaktivaciji perforina

V omenjenem doktorskem delu je Špela Konjar proučila vlogo cisteinskih proteinaz prei aktivaciji in inaktivaciji perforina. Ugotovila je, da je katepsin L pomembna, vendar ne edina proteinaza v tem procesu. Sodelovala je tudi pri raziskavah o vlogi inhibitorjev cisteinskih proteinaz v jedru. Doktorsko delo je bilo objavljeno v 3 člankih, četri članek pa je poslan v objavo v Immunology and Cell biology.

D.09 Mentorstvo doktorandom

COBISS.SI-ID: 251617280
2.
Znotrajcelični inhibitorji cisteinskih katepsinov v aktiviranih makrofagih

Vodja projekta sem predstavila vloga stefina B in cistatina F v aktiviranih makrofagih. Ob stimulaciji z LPS se stefin B anhaja v avtofagosomih kolokaliziran z LC3 proteinom. Povečano izražanje cistatina F mutante v endosomih pa vpliva na cepitve TLR9.

B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci

COBISS.SI-ID: 23121959
3.
Mehanizem citotoksičnosti prefibrilarnih agregatov stefina B in izbranih mutantov v razmerah in vitro/ex vivo

V omenjenem doktorskem delu je Slavko Čeru proučil predvsem agregate stefina B in vitro in v živih celiceh. Slavko je tudi sodeloval pri študijah o vlogi stefina B v jedru. Mentorica je bila Eva Žerovnik, so-mentor Vito Turk in delovna mentorice Nataša Kopitar-Jerala. Rezultate doktorskega dela smo objavili v 7 člankih.

D.09 Mentorstvo doktorandom

COBISS.SI-ID: 240588544
4.
Jederne in endosomalne funkcije inhibitorjev cisteinskih proteinaz v aktiviranih makrofagih

Vodja projekta je predstavila novejša spoznanja o vlogi inhibitorjev cisteinskih proteinaz v jedru, kakor tudi v citoplazmi in endosomih.

B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci

COBISS.SI-ID: 24291111
5.
Stefin B interagira s histoni in katepsinom L v jedru

Identificirali smo interakcijo stefina B z histoni. Pokazali smo, da povečano izražanje stefina B v jedru vpliva na procesiranje CUX 1 transkripcijskega faktorja. Kot posledico manjše cepitve CUX 1, smo v celicah v katerih je bil stefin B še dodatno izražen v jedru, izmerili počasnejši potek celičnega cikla. Z uporabo FRET metode smo potrdili interakcijo stefina B z krajšo varianto katepsina L v jedru živih celic.

B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci

COBISS.SI-ID: 4261402