J1-0317 — Letno poročilo 2008
1.
Raziskave vezave novih MurD ligandov z uporabo NMR metod, ki temeljijo na opazovanju signalov liganda

Predstavili smo raziskave interakcij novih inhibitorjev MurD ligaze z vezavnim mestom encima. Osredotočili smo se na NMR metode, ki ne zahtevajo izotopskega označevanja proteina. Te metode so osnovane na opazovanju signalov liganda. Za določanje konstante disociacije (KD) novih ligandov smo uporabili metode diferencialnega širjenja linij, longitudinalnega relaksacijskega časa in prenosa saturacije (STD). Z metodo nelinerane regresije smo iz NMR parametrov določili KD vrednosti. Naši rezultati so pokazali, da je za določanje KD najbolj natančna STD metoda.

B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci

COBISS.SI-ID: 3954202
2.
NMR spektroskopija kompleksov MurD ligaze z novimi inhibitorji

Postavili smo NMR metodologijo za prepoznavanje vezave in določanje vezavnih interakcij novih ligandov MurD ligaze z vezavno afiniteto v submilimolarnem območju, ki so jih sintetizirali v Lek farmacevtski družbi d.d..

F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso