1.

NMR-podprto načrtovanje zdravilnih učinkovin

Predstavili smo zmogljivosti in omejitve NMR metod pri raziskavah interakcij ligand-receptor. Lastnosti in uporabnost NMR metod, ki temeljijo na opazovanju signalov liganda ali proteina, smo razložili s prikazom dveh naših NMR študij novih inhibitorjev atraktivnih proteinskih tarč za razvoj novih protibakterijskih učinkovin. Posebej smo poudarili prednost NMR spektroskopije pri študijah dinamičnih procesov v molekularnih kompleksih. Pokazali smo vpliv konformacijske dinamike na stabilnost ligand-receptor interakcij in na inhibitorno aktivnost novih ligandov.

B.04 Vabljeno predavanje

COBISS.SI-ID: 4174618

2.

Raziskave vezave novih MurD ligandov z uporabo NMR metod, ki temeljijo na opazovanju signalov liganda

Predstavili smo raziskave interakcij novih inhibitorjev MurD ligaze z vezavnim mestom encima. Osredotočili smo se na NMR metode, ki ne zahtevajo izotopskega označevanja proteina. Te metode so osnovane na opazovanju signalov liganda. Za določanje konstante disociacije (KD) novih ligandov smo uporabili metode diferencialnega širjenja linij, longitudinalnega relaksacijskega časa in prenosa saturacije (STD). Z metodo nelinerane regresije smo iz NMR parametrov določili KD vrednosti. Naši rezultati so pokazali, da je za določanje KD najbolj natančna STD metoda.

B.03 Referat na mednarodni znanstveni konferenci

COBISS.SI-ID: 3954202

3.

NMR spektroskopija kompleksov MurD ligaze z novimi inhibitorji

Postavili smo NMR metodologijo za prepoznavanje vezave in določanje vezavnih interakcij novih ligandov MurD ligaze z vezavno afiniteto v submilimolarnem območju, ki so jih sintetizirali v Lek farmacevtski družbi d.d..

F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso

4.

NMR študije Lekovih derivatov zdravilnih učinkovin.

Izvedli smo NMR študije konfiguracije in konformacije izbranih Lekovih derivatov zdravilnih učinkovin in dokazali predpostavljene razlike v njihovi molekularni strukturi. Uporaba visokih magnetnih polj in določitev prostorskih konektivnosti je bila odločilna za pojasnitev vrste transformacije molekularnega ogrodja derivatov.

F.17 Prenos obstoječih tehnologij, znanj, metod in postopkov v prakso

COBISS.SI-ID: 4309530

5.

Mentorstvo podiplomskim študentom

Sem mentor dveh mladih raziskovalcev (M. Simčič in U. Zelenko), ki ju vpeljujem v raziskave konformacije, dinamike in interakcij v kompleksnih molekularnih sistemih z NMR metodami. M. Simčič raziskuje vezavne lastnosti novih inhibitorjev muramilnih ligaz. U. Zelenko sodeluje pri raziskavah vezave novih inhibitorjev membransko asociranega receptora Cyp51. Bila sem raziskovalni mentor Š. Klofutar za magistrsko delo, ki je osnovano na NMR študijah strukturnih in dinamičnih lastnostih proteinov.

D.09 Mentorstvo doktorandom

COBISS.SI-ID: 23454247