J2-9699 — Zaključno poročilo
1.
Podatki o izražanju genov in napovedovanje molekulski mehanizmov v celicah kvasovke

Predstavitev pristopa analize na genomski ravni z uporabo kvasovke Saccharomyces cerevisiae kot modelnega organizma za določitev vplivov različnih kemičnih perturbacij na evkariontske celice.

B.04 Vabljeno predavanje

COBISS.SI-ID: 20635431
2.
Analitični vmesnik do podatkov o ekspresiji in funkciji genov D. discoideum

Za raziskovalno skupnost modelnega organizma D. discoideum smo razvili spletni vmesnik za analizo in dostop do obsežnih podatkov o ekspresiji in funkciji genov (www.ailab.si/dictyExpress) [F.06]. Predstavlja novost glede načina dostopa do podatkov, saj poleg prikaza podatkov omogoča enostavno, interaktivno analizo izbranih genov. Dnevno ga uporablja ~15% raziskovalcev tega organizma po svetu. Vmesnik je vključen v referenčno bazo modelnega organizma (www.dictyBase.org) [F.16], ki beleži 60000 zadetkov mesečno.

F.06 Razvoj novega izdelka

COBISS.SI-ID: 7219028
3.
Gostujoči profesor na Universita di Pavia, Italija

Od septembra 2008 do junija 2009 je Blaž Zupan kot gostujoči profesor in raziskovalec deloval na Centru za tkivno inženirstvo na Univerzi v Pavii v Italiji. Tekom gostovanja je tam vzpostavil in organiziral skupino za bioinformatiko, katere cilj je razvoj informaticˇnih orodij za sˇtudij razvoja tkiv in zarodnih celic. V sodelovanju s prof. Riccardom Bellazzijem je tekom gostovanja izvedel vrsto tecˇajev s podrocˇja odkrivanja znanj in bioinformatike.

B.05 Gostujoči profesor na inštitutu/univerzi

COBISS.SI-ID: 7218516
4.
Obisk in raziskave na Univerzi v Toronu, Kanada

V oktobru in novembru 2009 je član projektne skupine dr. Uroš Petrovič obiskal laboratorij prof. Igorja Štagljarja, utemeljitelja tehnike membranskega dvohibridnega sistema kvasovke, na Univerzi v Torontu v Kanadi. Namen obiska je bil seznanitev s tehniko ter z njeno uporabo identifikacija proteinskih interaktorjev Izh2 proteina, homologa adiponektinskega receptorja kvasovke. Identificiranih je bilo deset potencialnih interaktorjev Izh2.

B.05 Gostujoči profesor na inštitutu/univerzi

COBISS.SI-ID: 2073200
5.
Zaključeni doktorati mladih raziskovalcev, ki so se usposabljali v okviru projekta

Na projektu sta sodelovala poleg ostalih sodelovala tudi dva mlada raziskovalca, ki sta v okvriu projektnih vsebin pripravila in zagovorila svoj doktorat. To sta Tomaž Curk in Minca Mramor (menor: Blaž Zupan). Oba sta bila dejavna tudi pri prenosu pridobljenih znanj v prakso, ter pri publiranju svojih rezutatov v mednarodnih revijah.

D.09 Mentorstvo doktorandom

COBISS.SI-ID: 250775808