Izdelali smo nizkogostotno DNA mikromrežo, ki omogoča ciljane študije ravnovesja hoelsterola in presnove zdravil pri miši. Analizirali smo vzorce mišjih jeter, iz študijah perturbacij ravnovesja holesterola in presnove zdravil, v odvisnosti od prehrane, različnih tretmajev in vnetja. Rezultate smo primerjali s komercialnimi mikromrežami Affymetrix in Agilent, pri čemer smo amalizirali identične RNA vzorce. Ugotovili smo, da je mikromreža Sterolgene v0 primerljiva s komercialnimi platformami v smislu zaznave sprememb v ravnovesju holesterola in presnovi zdravil.
COBISS.SI-ID: 23814361
Kot prvi smo pokazali, da izoforme na cAMP odzivnega element modulatorja Crem uravnavajo cirkadiano izražanje gena Cyp51 in drugih holesterogenih genov v jetrih. Pri miših divjega seva je izražanje Cyp51, Hmgs, Fpps in Sqs minimalno med CT12-CT16 in ima vrh med CT20–CT24. Cyp51, Fpps in Sqs izgubijo cirkadiano obnašanje, medtem ko se vrh izražanja Hmgcr premakne od CT20 do CT12. To se sklada s premikom razmerja latosterol/hoelsterol, kot smo zaznali z GC-MS. Prekomerno izražanje CREM? in ICER je imelo malo vpliva na Hmgcr bližnji promotor medtem ko se je odzival Cyp51promotor.
COBISS.SI-ID: 24714457