P1-0207 — Zaključno poročilo
1.
Presinaptično toksična sekretorna fosfolipaza A2 se internalizira v nevronom-podobne celice, kjer se hitro prenese v citosol.

Rezultati kažejo, prvič doslej, na translokacijo katere koli sPLA2 iz zunajceličnega prostora v celični citosol. Takšen dogodek bi bil lahko pomemben pri razlagi delovanja vrste homolognih endogenih sPLA2-encimov sesalcev, katerih vloga v različnih celičnih procesih še ni povsem pojasnjena.

COBISS.SI-ID: 21453095
2.
APOBEC3 inhibira replikacijo mišjega virusa dojke in vivo.

Proteini APOBEC3 so sesalski proteini naravne imunosti, ki sodelujejo pri obrambi organizma proti različnim retroelementom in retrovirusom. Ugotovili smo, da se virus dosti lažje razmnožuje v miših, ki nimajo proteina APOBEC3. To je prva študija proteinov APOBEC3, ki je pokazala, da imajo ti proteini pomembno vlogo pri zaviranju razmnoževanja retrovirusov v živem organizmu.

COBISS.SI-ID: 20903975
3.
Filogenomska analiza L1 retrotranspozonov pri deuterostomih.

L1 retrotranspozoni predstavljajo največjo posamezno komponento sesalskih genomov. Dokazali smo, da so v genomih skupine Deuterostomia prisotne tri, doslej neznane izjemno divergentne L1 skupine. Kot prvi smo dokazali, da je do izgube L1 raznolikosti in do izjemnega povečanja v številu kopij prišlo v predniku sodobnih sesalcev (Cynodontia) in pojasnili tudi vzroke. Pomembnost dosežka leži v pojasnitvi čez 600 milijonov let dolge evolucije L1 retrotranspozonov pri skupini Deuterostomia, v pojasnitvi nastanka nenavadne arhitekture sesalskih genomov in vpeljavi paleogenomskih raziskav.

COBISS.SI-ID: 20498215
4.
Interakcija evkariontskega citolizina, ki tvori pore, ekvinatoksina II z modelnimi membranami: raziskave z 19F NMR .

Ekvinatoksin II (EqTII) je eden od bolje proučenih aktinoporinov, proteinskih tvorcev por v lipidnih membranah, ki zelo učinkovito lizirajo celice, če le-te vsebujejo sfingomielin. Študije interakcije EqTII z lipidnimi miceli in biceli smo se lotili z uporabo 19F NMR. Ugotovili smo, da pri vezavi na lipidni dvosloj sodelujeta začetni del z N-končnim alfa-heliksom in del beta-sendviča, ki je bogat s triptofanskimi in tirozinskimi ostanki. Gre za prvo takšno študijo, ki omogoča vpogled vezave aktinoporinov na ravni posameznih, natančno določenih aminokislinskih ostankov.

COBISS.SI-ID: 18918873
5.
Tvorba pore pri ekvinatoksinu, evkariontskemu tvorcu por, terja gibljivo N-terminalno regijo in stablilen beta-sendvič.

Aktinoporini so proteini, ki tvorijo pore v lipidnih membranah. Med nastankom pore prihaja do konformacijskih sprememb, kjer se del molekule vgradi v lipidno membrano in tvori poro preko membrane. V članku smo preverili hipotezo, da se konformacijske spremembe v molekuli aktinoporinov zgodijo samo v predelu N-terminalnega dela. Rezultati skupaj nakazujejo, da je za tvorbo pore pri aktinoporinih pomemben gibljiv N-terminalni del in stabilen osrednji del molekule.

COBISS.SI-ID: 18475481
6.
Presinaptično toksična sekretorna fosfolipaza A2 se internalizira v nevronom-podobne celice, kjer se hitro prenese v citosol.

Rezultati kažejo, prvič doslej, na translokacijo katere koli sPLA2 iz zunajceličnega prostora v celični citosol. Takšen dogodek bi bil lahko pomemben pri razlagi delovanja vrste homolognih endogenih sPLA2-encimov sesalcev, katerih vloga v različnih celičnih procesih še ni povsem pojasnjena.

COBISS.SI-ID: 21453095