P1-0198 — Zaključno poročilo
1.
Ciprofloksacin inducira sintezo bakteriocinov bakterije Escherichia coli.

Antibiotiki, ki se vpletajo s podvojevanjem DNA, kakor tudi s sintezo celične stene inducirajo odziv SOS. Dokazali smo, da antibiotik ciprofloksacin inducira sintezo kolicinov, antibiotikov ozkega območja delovanja.

COBISS.SI-ID: 1509199
2.
Prevalenca plazmidov ColE1 in kvantifikacija inhibitorne aktivnosti kolicina K.

Ugotovili smo majhno prevalenco sinteze kolicina K in relativno visoko prevalenco plazmidov podobnih ColE1. Dokazali smo, da kolicin K izkazuje izrazito inhibitorno aktivnost proti uropatogenim sevom Escherichia coli.

COBISS.SI-ID: 1647695
3.
Penicillium mikrobiota v subglacialnem ledu Arktike.

Subglacialno okolje je do nedavnega veljalo za abiotično, pred nekaj leti pa so v njem odkrili psihrotolerantne bakterije. Naša skupina je prva na svetu opisala, da to okolje naseljujejo tudi evkarionti, sicer ekstremofilne glive. V subglacialnem ledu s sedimentom smo odkrili številne vrste rodu Penicilllium in melanizirane ter nemelanizirane kvasovke. Na osnovi biokemijske in molekularne karakterizacije arktičnih sevov in sevov osamljenih iz običajnih okolij smo ugotovili, da se arktični izolati razlikujejo v profilu sekundarnih metabolitov od vseh ostalih sevov, izoliranih po svetu.

COBISS.SI-ID: 1441161
4.
Rotacija LexA vezavne domene je predpogoj za specifično vezavo na DNA

Izdelan je bil model vezave dveh dimerov proteina LexA na operatorska zaporedja gena cka. Na podlagi mutant, premika v agarozne gelu in površinske plazmonske rezonance smo dokazali, da je potrebna rotacija DNA vezavne domene proteina LexA glede na domeno dimerizacije. Izsledki raziskave bodo podlaga za izdelavo novih zdravil.

COBISS.SI-ID: 1785423
5.
Prilagajanje spremembam v okolju s specializiranimi paralogi.

Ko so bakterije izpostavljene spreminjajočemu se okolju (npr. slanost ali temperaturo), je verjetno, da proteini niso aktivni v vseh fizikalnokemijskih pogojih. Naši izsledki kažejo, da prokarionti lahko preživijo ekstremne pogoje tako, da imajo dve ali več kopij genov na katere vplivajo nihanja v okolju, vsaka vrši enako vlogo le pod različnimi pogoji.

COBISS.SI-ID: 1863247