P1-0104 — Zaključno poročilo
1.
Prva strukturna in biokemijska opredelitev fosfodiesteraze cikličnih nukleotidov pri bakteriji Mycobacterium tuberculosis

Odkrili in okarakterizirali smo prvo znano fosfodiesterazo cikličnih nukleotidov iz bakterije M. tuberculosis (Mtb). Encim, imenovan Rv0805, spada v razred III cNMP-fosfodiesteraz in je metalo-encim s tipičnim zvitjem proteina, značilnim za proteine iz družine kalcineurinu podobnih fosfataz. V večini lastnosti se razlikuje od že dobro raziskanih in v medicini znanih evkariontskih cNMP-fosfodiesteraz. Zato je pomembna tarča pri odkrivanju vloge pri patogenezi Mtb in kot tak tudi potencialna tarča za razvoj novih zdravil.

COBISS.SI-ID: 3583770
2.
Dinamika sidrnega proteina nineina v epitelijski celicah, reorganizacija mikrotubulov in možna povezanost z medcelično komunikacijo

Vzpostavljanje stika med epitelijskimi celicami in polarizacija teh celic so posledica obsežne reorganizacije mikrotubulov in sestavin centrosomov. Ugotovili smo, da je sidrni protein ninein zelo dinamičen in da v epitelijskih celicah ni navzoč samo v centrosomih, temveč tudi v obliki diskretnih citoplazemskih delcev. Dokazali smo sproščanje nineinskih delcev iz centrosoma in njihov pomik vzdolž mikrotubulov do ne-centrosomskih celičnih sidrnih mest, ki so povezana s tesnimi stiki polariziranih celic. Pojav, navzoč med diferenciacijo epitelija, bi lahko bil povezan z medcelično komunikacijo.

COBISS.SI-ID: 3794970
3.
Uravnavanje gena za lanosterolno 14alfa-demetilazo (CYP51) v homeostazi holesterola

Naslovnični članek prinaša temeljna spoznanja o uravnavanju gena za lanosterolno 14alfa-demetilazo (CYP51), ki smo ga klonirali v predhodnih raziskavah. Encim po povratni zvezi uravnava homeostazo holesterola, in sicer preko proteinov, ki se vežejo na genske regulatorne elemente (SREBPs). Izpostavitev JEG-3 celic forskolinu, ki je sicer mediator od cAMP odvisne signalne poti, povzroči zgodnji odgovor CYP51, kar do sedaj še ni bilo opisano pri kakšnem holesterologenem genu.

COBISS.SI-ID: 20426969
4.
Naravna fenolna sredstva kot ko-inhibitorji glivnega encima benzoatna para-hidroksilaza (BPH): razvoj novih protiglivnih zdravil

V genomu nitaste glive C. lunatus (rastlinski in oportuni človeški patogen) smo našli gen, ki kodira benzoatno para-hidoksilazo (BPH), CYP53A15. Z izdelavo 3D modela in preučevanjem katalitskih značilnosti tega citokroma P450 smo dokazali, da so naravna fenolna sredstva inhibitorji BPH. Skupaj z benzoatom povečajo učinek protiglivnega delovanja. Ker evkarionti nimajo homologa za BPH, predstavlja obetavno tarčo za nova protiglivna sredstva. Dosežek je bil predstavljen v 21. številki publikacije SciBX (2008), ki jo izdajata BioCentury in Nature, kot zanimiv za razvoj novih protiglivnih zdravil.

COBISS.SI-ID: 3935770
5.
Podatkovna baza o eritropoetinskem receptorju

Kombinacija preglednega članka o ertripoetinskem receptorju ter izdelane podatkovne baze s številnimi spletnimi povezavami z drugimi genskimi in proteinskimi podatkovnimi bazami. Objavljeno v spletni izdaji revije Nature.

COBISS.SI-ID: 23209945