1.

Inhibitorni fragment invariantne verige p41 lahko regulira aktivnost cisteinskih katepsinov pri predstavitvi antigenov.

Primerjava struktur je nakazala, da selektivnost interakcij med cisteinskimi katepsini in fragmentom p41 še zdaleč ni razumljena in zahteva nadaljne raziskave. Pokazali smo, da fragment p41 inhibira tudi človeške katepsine V, K, F in najbrž tudi O in mišje katepsin L s Ki v nizkem nM območju. Inhibicija pa je bila pokazana tudi za katepsin S. Na podlagi teh spoznanj sklepamo, da je regulacija proteolitske aktivnosti večine cisteinskih katepsinov z fragmentom p41 pomemben in razširjen kontrolni mehanizem antigene prezentacije.

COBISS.SI-ID: 21555495

2.

PURY: podatkovna baza geometrijksih parametrov za določevanje struktur kompleksov heteromolekul z ....

Pripravljena je bila podatkovna baza z mrežnim dostopom za pripravo geometrijskih parametrov na osnovi statistične obdelave vseh struktur malih molekul deponiranih v Cambridge Crystal Structure Database. S tem so tudi male molekule dobile parametre primerljive s kvaliteto parametrov za preostanke amino in nukleinksih kislin.

COBISS.SI-ID: 22118695

3.

Pomembna volga prolinske izomerizacije pri tvorbi tetramer stefina B.

Tetramerna struktura mutante P79S stefina B je izpostavila pomen prolinske izomerizacije pri procesu amiloidne fibrilacije.

COBISS.SI-ID: 20673831

4.

Razlike v interakcijah med mišjima stefinoma A1 in A2 (Stfa1 in Stfa2) in papainu podobnimi endo- in eksopeptidazami.

Primerjava inhibicijskih konstant med človeškimi in mišjimi katepsini in stefini je pokazala na razlike med mišjimi in človeškimi proteini vključenimi v intracelularno razgradnjo in imunski odziv in nakazala na potencialne razlike v mehanizmu. Citiran 2x.

COBISS.SI-ID: 20097063

5.

Kristalna struktura govejega katepsina B v kompleksu z NS-134, dvoglavim epoksisukcinilnim inhibitorjem, ...

Ta struktura je dokazala, da se dvoglavi epoksisukcinilni inhibitorji zares vežejo vzdolž aktivnega mesta kot je bilo predvideno (Turk et al., 1996,Biochemistry 34, 4791-4797). Citiran 9x.

COBISS.SI-ID: 18604327