P1-0002 — Zaključno poročilo
1.
MD integracija & mol. vibracijska analiza I. Novi simplektični integratorji. II. Simulacije ne-linearnih molekul. III. IR spekter vode.

Objavili smo tri zaporedne članke v reviji Journal of Chemical Physics, v katerih smo predstavili in analizirali novo simplektično metodo za simulacijo molekulske dinamike - SISM. Metoda SISM se razlikuje od drugih metod, ki uporabljajo razcepitvene sheme, po uvedbi analitične obravnave visokofrekvenčnih nihanj. S tem pristopom dosežemo uporabo znatno večjega integracijskega koraka in večjo natančnost računanja kot z drugimi metodami istega reda. Posebna vrednost teh del pa je v združitvi dveh pristopov, t.j. simulacije molekulske dinamike in klasične teorije molekulskih vibracij.

COBISS.SI-ID: 3208474
2.
Graf-teoretične matrike v kemiji

Monografija na temo uporabe teorije matrik in grafov v matematični kemiji.

COBISS.SI-ID: 3684634
3.
Večskalne simulacije mehke snovi : sprotno spremenljiva resolucija

Pregledni članek o večskalni simulaciji mehke snovi. Pregled čez simulacijske pristope za simulacijo mehke snovi objavljen v prestižni reviji "Annual Review of Physical Chemistry".

COBISS.SI-ID: 3863834
4.
Mrežna dinamika proteinskega kristala

Calculating neutron and x-ray scattering from large-scale all-atom simulations.

COBISS.SI-ID: 3794714
5.
Novo potencialno polje za simulacijo molekulske dinamike AlPO_4-34 molekularnega sita

Novo razvito potencialno polje za izračun simulacije molekulske dinamike aluminofosfatov.

COBISS.SI-ID: 3707418
6.
MD integracija & mol. vibracijska analiza I. Novi simplektični integratorji. II. Simulacije ne-linearnih molekul. III. IR spekter vode.

Objavili smo tri zaporedne članke v reviji Journal of Chemical Physics, v katerih smo predstavili in analizirali novo simplektično metodo za simulacijo molekulske dinamike - SISM. Metoda SISM se razlikuje od drugih metod, ki uporabljajo razcepitvene sheme, po uvedbi analitične obravnave visokofrekvenčnih nihanj. S tem pristopom dosežemo uporabo znatno večjega integracijskega koraka in večjo natančnost računanja kot z drugimi metodami istega reda. Posebna vrednost teh del pa je v združitvi dveh pristopov, t.j. simulacije molekulske dinamike in klasične teorije molekulskih vibracij.

COBISS.SI-ID: 3208474