Metilacija DNA je dobro preučena epigenetska modifikacija pri sesalcih. Spremembe v vzorcu metilacije so lahko povezane z različnimi bolezenskimi stanji, vključno s psihopatologijami. Samomor je globalni javno-zdravstveni problem, saj je Slovenija po stopnji samomorov ena izmed vodilnih evropskih držav. Zato si prizadevamo identificirati bio-označevalce, ki bi bili primerni za klinično uporabo v psihiatriji; ena od možnosti bi lahko bila uporaba metilacije DNA kot bio-označevalca. Cinkov prst 714 (ZNF714) je protein, ki spada v veliko družino proteinov, ki se lahko vežejo na DNA. V pilotni študiji globalnega vzorca metilacije smo ZNF714 opredelili kot nov kandidatni gen. Naš vzorec je vključeval kri in tkivo štirih različnih možganskih področij (hipokampus, insula, amigdala in Brodmannovo področje 46. Z uporabo ciljno usmerjenega bisulfitnega sekvenciranja naslednje generacije smo pridobili informacije o metilaciji otoka CpG, ki se nahaja v promotorski regiji ZNF714. Opazili smo znatno znižanje ravni metilacije pri žrtvah samomora v vseh štirih možganskih regijah in krvi, z zelo primerljivim vzorcem metilacije med vsemi možganskimi regijami in krvjo. Z analizo izražanja gena smo v področju hipokampusa zaznali izrazito zvišano izražanje ZNF714 pri žrtvah samomora. Zaradi visoke pojavnosti duševnih motenj in samomorilnega vedenja je potreba po dodatni diagnostiki in zdravljenju resna. ZNF714 je tako eden izmed možnih kandidatov za krvni bio-označevalec samomorilnega vedenja.
COBISS.SI-ID: 41029379
Na področju psihiatrije je v primerjavi z drugimi medicinskimi področji zelo pomembna identifikacija bioloških označevalcev, ki bi dopolnili sedanjo metodologijo kliničnih razgovorov in omogočili bolj objektivno in hitrejšo klinično diagnozo ter natančno spremljanje odziva na zdravljenje in remisije. Trenutni tehnološki razvoj omogoča analizo različnih bioloških oznak, pridobljenih s pomočjo uporabe visokopretočnih "omskih" tehnologij ob razumnih stroških, zato "omske" študije vstopajo v raziskave psihiatrije. Vendar pa takšna količina podatkov zahteva povsem novo vrsto spretnosti pri obdelavi podatkov, preden se lahko pridobijo klinično koristne informacije. Doslej uporabljen klasični pristop k analizi podatkov ni pomembno prispeval k identifikaciji bio-označevalcev v psihiatriji. Obsežne količine podatkov bi lahko prišle na višjo raven, če bi uporabili umetno inteligenco v obliki algoritmov strojnega učenja. Trenutni bi objavljenih veliko študij, ki bi preučevale uporabo strojnega učenja v psihiatriji, vendar iz peščice študij opisanih v sledečem preglednem članku lahko že vidimo, da obstaja potencial za oblikovanje presejalnega nabora bio-označevalcev za različne psihopatologije, vključno s samomorom.
COBISS.SI-ID: 46033411
Ozadje: Glede na to, da je približno 70% miRNA v telesu nevronskega izvora, smo kritično ocenili sedanje študije o miRNA in samomorilnem vedenju. Materiali in metode: Za nadaljnjo opredelitev vloge miRNA pri samomoru smo iskali študije o zunajceličnih veziklih (eksosomih), saj so miRNA posebej obogatene v eksosomih. MiRNA imajo tudi pomembne fiziološke vloge in lahko prečkajo krvno-možgansko pregrado ter sodelujejo v komunikaciji med celicami tako z bližnjimi kot oddaljenimi celicami. Rezultati in zaključek: Ta kritična ocena kaže, da je več miRNA lahko tesno povezanih z nevrofiziologijo, samomorilnim vedenjem in psihiatričnimi motnjami. Jasno prekrivanje pa je slabo bodisi zaradi različnih uporabljenih metodologij bodisi zaradi molekularnih razlik med samomorilnim vedenjem in preučevanimi psihiatričnimi motnjami.
COBISS.SI-ID: 44314627