P1-0010 — Vmesno poročilo
1.
Namen te posebne številke mednarodne revije Molecules, ki jo je urejela S. Golič Grdadolnik, je bil pritegniti prispevke o vseh vidikih uporabe NMR spektroskopije pri načrtovanju in odkrivanju molekul, ki so kandidati za razvoj zdravil, s posebnim poudarkom na študijah NMR, ki obravnavajo molekularno gibljivost glede na biološki profil molekul ali uporabnost tarč za razvoj novih zdravil.

Molecules. Golič Grdadolnik, Simona (gostujoči urednik 2020, član uredniškega odbora 2020-). Basel: MDPI, 1996-. ISSN 1420-3049. http://www.mdpi.com/journal/molecules. [COBISS.SI-ID 18462981]

C.03 Vabljeni urednik revije (guest-associated editor)

COBISS.SI-ID: 18462981
2.
Water hydrogen bonding around small hydrophobic solutes

Vabljeno predavanje CMSP Seminar (Atomistic Simulation Webinar Series), International Centre for Theoretical Physics, Trieste, Italy, 10. 3. 2021. [COBISS.SI-ID 62269187]

B.04 Vabljeno predavanje

COBISS.SI-ID: 62269187
3.
Raziskovalci s Kemijskega inštituta prišli do učinkovitega absorbcijskega premaza

Pogovorna radijska oddaja o znanstvenem dosežku.

B.06 Drugo

COBISS.SI-ID: 6635802
4.
NMR-podprte študije interakcij ligand-protein

Z uporabo naših najnovejših študij vezave ligandov na proteinsko tarčo muramil ligazo D (MurD) smo predstavili zmogljivosti NMR metod za identifikacijo in karakterizacijo interakcij ligand-protein. Posebno pozornost smo namenili edinstveni sposobnosti NMR spektroskopije, da zagotovi kombiniran strukturno-dinamični vpogled v vezavo ligandov na proteine.

B.04 Vabljeno predavanje

COBISS.SI-ID: 6691610
5.
NMR struktura nevezanega rekombinantnega človeškega živčnega rastnega faktorja (rhNGF) v tekočini (PDB vnos 6YW8)

Za opis molekularnih determinant vezave ATP na rhNGF in opredelitev njegove funkcionalne vloge smo določili NMR strukturo nevezanega rhNGF v raztopini. NOE, pridobljene iz spektrov 3D 15N- in 13C-NOESY-HSQC, smo uporabili za konstrukcijo in validacijo 3D strukturnega modela. Struktura v raztopini je podobna strukturi, določeni z rentgensko kristalografijo za rhNGF- v kompleksu z ligandi, zlasti glede topologije cisteinskega vozla, medtem ko kaže opazne razlike znotraj fleksibilnih zank. Poleg tega je v NMR strukturi nevezanega rhNGF njegov N-terminalni del prožen in nima posebne nagnjenosti k sekundarni strukturi, medtem ko je v rentgenskih kristalnih strukturah kompleksa rhNGF-TrkA vključen v interakcijsko površino in zavzame konformacijo vijačnice. Opozoriti je treba, da ta NMR struktura ne predstavlja le prve rešene strukture rhNGF v tekočini, ampak prvo kdaj koli objavljeno strukturo nevezanega rhNGF.

B.06 Drugo

COBISS.SI-ID: 14902275