Pri zdravih asimptomatskih posameznikih (starih 25-49 let) smo s presečno raziskavo analize krvnih serumov na tešče določili vrednosti celokupnega in direktnega bilirubina ter adipokinov in vnetnih mediatorjev, kot so interlevkin-6, tumor nekrotizirajoči faktor alfa (TNF-?), C-reaktivni protein (CRP) in ostalih biokemijskih parametrov. Preiskovance smo razdelili v tiste z normalno telesno težo in tiste s prekomerno telesno težo. Ugotovili smo značilno negativno povezavo med celokupnim bilirubinom in CRP, TNF-?, visfatinom in rezistinom ter negativno povezavo med bilirubinom in adiponektinom v obeh skupinah. Zanimivo opaženje je bilo tudi, da so vrednosti vnetnih citokinov visfatina, rezistina in CRP bili dobri prediktorji serumskih vrednosti bilirubina.
COBISS.SI-ID: 23806211
Berberin lahko poviša serumske vrednosti bilirubina. Mehanizem je izpodrivanje vezanega bilirubina iz serumskega albumina.
COBISS.SI-ID: 34256857
Bilitranslokaza (BTL) je transmembranski protein, ki preko celične membrane prenaša bilirubin iz krvi v jetrne celice. Kot smo že ugotovili, obstajajo štirje hidrofobni transmembranski segmenti (TM1 – ??TM4), ki predstavljajo strukturo transmembranskega kanala proteina BTL. V naših prejšnjih študijah je bila struktura 3D ločljivosti TM2 in TM3 transmembranskih fragmentov BTL v micelarnih medijih natrijevega dodecil sulfata (SDS) rešena s spektroskopijo jedrske magnetne resonance (NMR) in simulacijami molekularne dinamike (MD). 3D-struktura visoke ločljivosti četrte transmembranske regije (TM4) BTL je bila ocenjena z uporabo NMR spektroskopije v dveh različnih micelarnih medijih, anionskem SDS in zwitterionskem DPC (dodecilfosfoholin). Predstavljeni eksperimentalni podatki so razkrili obstoj ?-spiralne konformacije v osrednjem delu TM4 v obeh micelarnih medijih. V primeru površinsko aktivne snovi SDS opazimo ?-spiralno konformacijo za regijo Pro258 – Asn269. Uporaba zwitterionske DPC micele vodi do tvorbe amfipatične ?-vijačnice, za katero je značilno razširitev osrednje ?-vijačnice v fragmentu TM4 na Phe257 – Thr271. Kompleksni značaj dinamičnih procesov v peptidu TM4 v obeh površinsko aktivnih snoveh smo analizirali na podlagi podatkov o relaksaciji, pridobljenih na izotopih 15 N in 31 P.
COBISS.SI-ID: 6693146
Poudarek te raziskave je bil membranski prenašalec bilirubina, tj. bilitranslokaza (BTL). BTL ima široko tkivno izražanje (žilni endotelij, absorpcijski in izločevalni epitelij) in lahko prenaša najrazličnejše poliaromatske spojine. Z razpoložljivimi podatki o BTL (pKi [mmol / L] za 120 organskih spojin) so bili razviti robustni in zanesljivi modeli QSAR za transportno aktivnost BTL, ki so bili ekstrapolirani na 300 fenolnih spojin. Za vse spojine so bili ocenjeni profili prenašalcev. Rezultati kažejo, da prehranski fenoli in nekatere kandidatne zdravilne učinkovine verjetno vplivajo na BTL. Predstavljeni so tudi povzetki napovedi iz modelov BTL in zadetki / napovedi 20 prevoznikov s platform Metrabase in Chembench. S takšnimi skupnimi analizami prevoznikov smo pridobili nov vpogled v razjasnitev funkcionalne vloge BTL. Glede omejevanja modelov za navidezno profiliranje medsebojnih povezav transporterjev bi lahko uporabili računski pristop, ki je opisan v tej študiji. Objavljeni pristopi v članku so uporabni za nadaljnji razvoj zanesljivih modelov in silico za katerikoli membranski prenašalec, če so na voljo eksperimentalni podatki in vitro.
COBISS.SI-ID: 6582042
Bilitranslokaza (BTL) je bilirubinski membranski transporter, ki ima podobno tkivno porazdelitev in funkcionalne lastnosti kot nekateri drugi člani družine organskih anioniskih prenašalcev (angl. Organic Anion Transporter). BTL je edini član, ki je uvrščen v družino bilirubinskih transporterjev. Glede svojih edinstvenih lastnosti je bilitranslokaza potencialno zanimiva tarča zdravil. Zaradi velikega biološkega in farmacevtskega zanimanja za razjasnitev strukture in funkcionalnih mehanizmov transmembranskih proteinov je bilo razvitih več rračunalniških metod za premagovanje eksperimentalne vrzeli. V kombinaciji z eksperimentalnimi podatki računalniške simulacije omogočajo hitre, poceni in uspešne napovedi molekularne strukture neraztopljenih beljakovin. Zanesljivost napovedi je odvisna od razpoložljivosti in natančnosti eksperimentalnih podatkov, povezanih s strukturnimi informacijami. V tem pregledu so predlagane naslednje metode za razjasnitev struktur v in silico pogojih: napovedi transmembranskih regij, odvisne od zaporedja, napovedi transmembranskih interakcij vijačnice in vijačnice, spiralni mehanizmi v membranskih modelih in testiranje njihove stabilnosti s simulacijami molekularne dinamike. Prav tako prikazujemo uporabo zgoraj naštetih računskih metod s predlaganjem modela za molekularno strukturo transmembranskega proteina bilitranslokaze.
COBISS.SI-ID: 6110234