J1-8150 — Zaključno poročilo
1.
Protein gp6 bakteriofaga GIL01 sproži litični cikel v bakteriji Bacillus thuringiensis

Anja Pavlin je v sklopu projeta izvedla magistrsko nalogo v kateri dokaže, da mali protein gp6 deluje kot genetsko stikalo virusa, da z vezavo na DNA preklopi v litični cikel virusa. Za delo je prejela Univerzitetno prešernovo nagrado.

D.10 Pedagoško delo

COBISS.SI-ID: 4890191
2.
Biološka vloga interakcije bakterijskih egerolizinov z lipidi

Eva Kočar je v sklopu projeta izvedla magistrsko nalogo v kateri dokaže, da protein RahU bakterije P. aeruginosa interagira z membrano insektnih celic in vstopi v jedro fiksiranih humanih celic kjer morebiti interagira z DNA. Za delo je prejela Prešernovo nagrado Biotehniške fakultete.

D.10 Pedagoško delo

COBISS.SI-ID: 5068623
3.
Biotehnološka uporaba bakterijskih mikrorazdelkov

Bakterijski mikrorazdelki so proteinski organeli, ki se samo-sestavijo in vključujejo encime, ki izvajajo specifične metabolne procese. Zavoljo razvoja metode za analizo interakcij protein-DNA je Jan Otoničar v svojem diplomskem delu pripraviti protokol, ki omogoča pakiranje transkripcijskega faktorja LacI, ki je imel na amino-terminalnem koncu kratko peptidno sekvenco proteina PduD in na karboksi-terminalnem koncu izboljšani fluorescenčni protein (EGFP), v mikrorazdelek Pdu direktno v bakteriji. Zasnova eksperimenta omogoča, da mikrorazdelke izoliramo z afinitetno kromatografijo. Rezultati naloge so temelj za razviti protokol, ki smo ga realizirali tekom izvedbe projekta, za usmeritev odseka DNA v bakterijski mikrorazdelek. Ta pristop ima potencial v biotehnologiji.

F.05 Sposobnost za začetek novega tehnološkega razvoja

COBISS.SI-ID: 9282937
4.
Mali proteini virusa, ki nadzirajo usodo bakterije

V vabljenem predavanaju predstavimo izsledke raziskave in prikažemo pomen malih proteinov na uravnavanje transkripcije pri bakterijah.

B.04 Vabljeno predavanje

COBISS.SI-ID: 5184591
5.
Regulatorni sistem proteina LexA

Poglavje je bilo napisano za širok nabor bralcev (tudi za študente), opišemo značilnosti in delovanje globalnega bakterijskega transkripcijskega faktorja ter ponazorimo, kako antibiotiki modulirajo transkripcijske odzive in povezane procese v bakterijah, ki vodijo tudi do porajanja odpornosti proti antibiotikom.

D.10 Pedagoško delo

COBISS.SI-ID: 61057539