Mimetiki biološko aktivnih peptidov: strategije načrtovanja in sinteze

Cilji projekta so nacrtovanje in sinteza mimetikov zaporedij dveh do štirih amino kislin z visokim delezem ionogenih amino kislin arginina, lizina, asparaginske kisline in glutaminske kisline. V teh sekvencah je ena izmed preostalih neionogenih amino kislin prednostno prolin (npr. Arg-Gly-Asp, Lys-Pro-Arg, Lys-Pro-Arg-Arg, Arg-Pro-Lys, Lys-Pro-Arg, Arg-Lys-Asp, Pro-Arg ). Omenjeni vzorci v aminokislinskih zaporedjih imajo odlocilen pomen za vezavo nekaterih biološko pomembnih majhnih peptidov npr. tuftsina, timopentina, RGD peptidov, inhibitorjev trombina, bradikinina, nevrotenzina in substance P na njihove receptorje. V okviru tega projekta pripravljeni mimetiki bodo vsebovali primerno ogrodje, na katero bo v ustrezni medsebojni legi in orientaciji vezanih vec ionogenih skupin. Uporabili jih bomo kot gradnike za peptidomimetike navedenih in bolj kompleksnih peptidov ter tako pripravljene spojine biološko ovrednotili. Koncept oponašanja vecih sosednjih ionogenih amino kislin v aminokislinskem zaporedju z eno samo strukturo, iz katere po kombinaciji z drugimi fragmenti dobimo peptidomimetik, predstavlja nov pristop k nacrtovanju peptidomimetikov. Pricakujemo, da bo uporaba te nove strategije v raziskavah peptidomimetikov dala nove ligande za integrine in nove inhibitorje trombina z antitromboticnim delovanjem.