Protivirusni proteini APOBEC3 in njihova vloga pri obrambi proti retroelementom

Vse od kar so odkrili proteine APOBEC3, so predmet najbolj vročih raziskav na področju virusa HIV1. Ker veljajo za obetavno tarčo protivirusnih terapij, jih proučujejo v številnih laboratorijih. Kljub temu njihovo delovanje še ni pojasnjeno. V tem projektu uporabljamo najmodernejše metode za študij proteinov APOBEC3 in raziskave so v samem vrhu raziskav virusov. Rezultati naših raziskav niso zanimivi samo za ozek krog znantvenikov, ampak bodo močno prispevali k razumevanju retrovirusov kar bo narekovalo razvoj novih terapij. Poleg tega bomo razvili nove metode za analizo proteinov in RNA v celici. Rezultati metode CLIP lahko odprejo popolnoma novo področje raziskav proteinov APOBEC3. Predlagane raziskave bodo pripomogle k boljši kvaliteti biokemijskih in biomedicinskih raziskav v Sloveniji.

Dolgoročni cilj naših raziskav je razvoj protivirusnih terapij. Zaradi toksičnosti zdravil, ki se sedaj uporabljajo pri zdravljenju okužbe z virusom HIV1 in pojava rezistentnih sevov virusa HIV1 so se raziskave razvoja novih protivirusnih terapij preusmerile v analizo specifičnih interakcij med virusom in gostiteljsko calico, kar je bolj ciljan pristop k razvoju novih terapij. Proteini APOBEC3 igrajo pomembno vlogo pri privzeti imunosti, ki se bojuje proti endogenim in eksogenim virusom. Predmet naših raziskav je razumevanje njihovega delovanja, saj je leto neobhodno potrebno za razvoj novih metod zdravljenja. Farmakološko zanimivi rezultati, kot na primer nove RNA tarče proteinov, bodo prispevali k tesnejšemu sodelovanju z farmacevtsko industrijo in posledično boljši povezavi med znanostjo in gospodarstvom v Sloveniji.