Nalaganje ...
Projekti / Programi vir: ARIS

Raziskave teranostičnega potenciala egerolizinskih proteinov v boju proti raku sečnega mehurja

Raziskovalna dejavnost

Koda Veda Področje Podpodročje
4.06.00  Biotehnika  Biotehnologija   

Koda Veda Področje
3.04  Medicinske in zdravstvene vede  Medicinska biotehnologija 
Ključne besede
, apoptoza, egerolizinska družina proteinov, kardiolipin, lipid, lipidni raft, proteinska družina MACPF, membrana, molekulski označevalec, bukov ostrigar, sfingomielin, rak sečnega mehurja.
Vrednotenje (metodologija)
vir: COBISS
Upoš. tč.
9.173,1
A''
1.405,8
A'
4.854,26
A1/2
6.287,82
CI10
19.762
CImax
1.597
h10
63
A1
32,82
A3
7,37
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan 12. oktober 2025; Podatki za izračun ocene A3 se nanašajo na obdobje 2020-2024
Podatki za razpise ARIS ( 04.04.2019 - Programski razpis, arhiv )
Baza Povezani zapisi Citati Čisti citati Povprečje čistih citatov
WoS  790  19.560  16.162  20,46 
Scopus  789  21.591  17.964  22,77 
Organizacije (3) , Raziskovalci (24)
0481  Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  39095  dr. Miha Bahun  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2023 - 2025  50 
2.  53554  Tadeja Bele  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2024 - 2025  15 
3.  24290  dr. Matej Butala  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2023  246 
4.  53283  Maja Hostnik  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2023  20 
5.  54731  dr. Jan Kejžar  Biotehnologija  Mladi raziskovalec  2023 - 2025  14 
6.  51231  dr. Anja Pavlin  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2023  29 
7.  10873  dr. Nataša Poklar Ulrih  Kemija  Raziskovalec  2023 - 2025  886 
8.  55861  Larisa Lara Popošek  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2023 - 2025  12 
9.  15328  dr. Kristina Sepčić  Biokemija in molekularna biologija  Vodja  2023 - 2025  774 
10.  33137  dr. Matej Skočaj  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2023 - 2025  127 
11.  06905  dr. Tom Turk  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2023  651 
12.  56942  Luka Žeželj  Biokemija in molekularna biologija  Mladi raziskovalec  2023 - 2025 
0105  Nacionalni inštitut za biologijo
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  29297  dr. Katja Kološa  Biologija  Raziskovalec  2023 - 2025  54 
2.  34200  dr. Matjaž Novak  Biologija  Raziskovalec  2023 - 2025  79 
3.  32094  dr. Alja Štern  Varstvo okolja  Raziskovalec  2023 - 2025  94 
4.  09864  dr. Magda Tušek Žnidarič  Biologija  Upokojeni raziskovalec  2023 - 2025  421 
5.  20767  dr. Bojana Žegura  Biologija  Raziskovalec  2023 - 2025  389 
0381  Univerza v Ljubljani, Medicinska fakulteta
št. Evidenčna št. Ime in priimek Razisk. področje Vloga Obdobje Štev. publikacijŠtev. publikacij
1.  15873  dr. Mateja Erdani Kreft  Nevrobiologija  Raziskovalec  2023 - 2025  462 
2.  25780  dr. Samo Hudoklin  Nevrobiologija  Raziskovalec  2024 - 2025  116 
3.  17889  Nada Pavlica Dubarič    Tehnični sodelavec  2024 - 2025 
4.  28393  dr. Nataša Resnik  Biokemija in molekularna biologija  Raziskovalec  2023 - 2025  99 
5.  38479  dr. Aleksandra Šakanović  Nevrobiologija  Raziskovalec  2023  29 
6.  08279  dr. Peter Veranič  Nevrobiologija  Raziskovalec  2023 - 2025  374 
7.  19588  Sabina Železnik    Tehnični sodelavec  2024 - 2025 
Povzetek
Razvoj novih metod, ki omogočajo prostorsko zaznavanje specifičnih membranskih lipidov s ciljem proučevanja njihove vpletenosti v celične funkcije, ali za ciljanje lipidov v terapevtske namene, predstavlja hitro razvijajoči se pristop v biomedicini. Glavna prednost ciljanja lipidov v primerjavi s ciljanjem proteinov je, da lipidi niso nagnjeni k razvoju odpornosti, ki se lahko pojavlja pri različnih proteinskih receptorjih.  Sfingomielin (SM) je poglavitni sfingolipid celičnih membran vretenčarjev, katerega vsebnost in povezovanje z ostalimi membranskimi lipidi vpliva na različne celične funkcije. Sfingomielin se še posebej dobro povezuje s holesterolom, s katerim tvori membranske rafte. Gre za membranske domene, ki preko segregacije za rafte specifičnih proteinov delujejo kot funkcionalne platforme v številnih procesih v zdravi celici ter pri bolezni (npr. imunsko signaliziranje, interakcija s patogeni, rak). Preurejanje membranskih lipidov poteka tudi med procesom programirane celične smrti (apoptoze). Pri apoptozi se na površini plazemske membrane izpostavijo lipidi, ki normalno niso vezani na zunanjo plast te membrane (npr. fosfatidilserin ali kardiolipin). Ti lipidi predstavljajo signale, ki fagocitom omogočajo prepoznavanje apoptotične celice in njeno odstranitev. Izbrani egerolizini, lipidno-vezavni proteini iz užitnih gob rodu Pleurotus, predstavljajo odlične kandidate za detekcijo in označevanje zgoraj omenjenih lipidov. Zaradi sposobnosti specifične interakcije s kardiolipinom, s SM v kompleksu s holesterolom, kakor tudi s prostim SM, so egerolizini pomembo orodje za detekcijo teh lipidov v membranah živih sesalskih celic. Poleg tega egerolizini v prisotnosti specifičnega proteinskega partnerja, ki vsebuje MACPF domeno, tvorijo pore v tarčnih membranah. Te citolitične komplekse lahko uporabljamo za uničevanje, ki vsebujejo egerolizinski membranski lipidni receptor. Egerolizin ostreolizin A6 (OlyA6) iz glive Pleurotus ostreatus specifično zaznava in se veže na SM v kompleksu s holesterolom v membranskih raftih, ter predstavlja idealno netoksično orodje za proučevanje strukture in dinamike raftov v živih celicah. Poleg tega nativni izolat te glive, ki vsebuje zmes OlyA6 in njegovega MACPF-partnerskega proteina specifično uničuje urotelijske rakave celice, ki v primerjavi z normalnimi celicami imajo povečano vsebnost membranskih raftov. Poleg tega vsebuje apikalna membrana zdravih urotelijskih celic posebne proteine, uroplakine, ki urotelijske plake urejajo v kristalne strukture, ki onemogočajo vezavo kompleksa OlyA6/PlyB na lipidne rafte. Mutanta OlyA6-E69A lahko interagira tako s prostim, kot tudi s holesterolom vezanim SM. Zadnji od preučevanih proteinov je erilizin A (EryA) iz glive P. eryngii, ki se ne veže na membrane, ki vsebujejo SM/holesterol in posledično ni označevalec membranskih raftov, se pa veže na kardiolipin.  V predlaganem projektu želimo kritično ovrednotiti potencial rekombinantnih lipidno-vezavnih egerolizinskih proteinov OlyA6, OlyA6-E69A in EryA, samih ali v kombinaciji z MACPF-proteinskimi partnerji, kot teranostičnih sredstev v biomedicini. Fluorescenčno označen EryA, ki zaznava kardiolipin, bo ovrednoten kot molekularni označevalec apoptotičnih sesalskih celic, medtem ko bosta fluorescenčno označena proteina OlyA6 in njegov mutant E69A testirana kot komplementarna orodja za detekcijo in proučevanje prostega in s holesterolom vezanega SM v membranah živih sesalskih celic. S fluorescenčno označenimi egerolizini bomo ravno tako specifično označili urotelijske rakave celice, ali pa z egerolizin/MACPF kompleksi povzročili njihovo permeabilizacijo. Z vezavnimi testi na umetnih in bioloških membranah, fluorescenčnimi mikroskopskimi tehnikami in testi toksičnosti bomo izbrali najbolj učinkovit egerolizin/MACPF kompleks za nadaljnjo uporabo pri zdravljenju urotelijskega raka.
Zgodovina ogledov
Priljubljeno