Projekti / Programi
Programiranje RNA-proteinskih kondenzatov v sesalčjem razvoju
Koda |
Veda |
Področje |
Podpodročje |
4.06.00 |
Biotehnika |
Biotehnologija |
|
Koda |
Veda |
Področje |
3.04 |
Medicinske in zdravstvene vede |
Medicinska biotehnologija |
RNA vezavni proteini, embrionalne matične celice, RNA procesiranje, paraspekli, parapege, nuklearne granule, celična diferenciacija, dolge nekodirajoče RNA, RNA
Podatki za zadnjih 5 let (citati za zadnjih 10 let) na dan
12. oktober 2025;
Podatki za izračun ocene A3 se nanašajo na obdobje
2020-2024
Podatki za razpise ARIS (
04.04.2019 - Programski razpis,
arhiv
)
Baza |
Povezani zapisi |
Citati |
Čisti citati |
Povprečje čistih citatov |
WoS |
440
|
18.466
|
17.090
|
38,84
|
Scopus |
438
|
19.187
|
17.809
|
40,66
|
Organizacije (2)
, Raziskovalci (8)
0104 Kemijski inštitut
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
1. |
34525 |
dr. Maja Marušič |
Kemija |
Raziskovalec |
2023 - 2025 |
59 |
2. |
50784 |
dr. Miha Modic |
Biokemija in molekularna biologija |
Vodja |
2023 - 2025 |
69 |
3. |
10082 |
dr. Janez Plavec |
Kemija |
Raziskovalec |
2023 - 2025 |
1.339 |
4. |
57147 |
Anja Trupej |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2023 - 2025 |
13 |
5. |
34667 |
dr. Jernej Ule |
Biokemija in molekularna biologija |
Raziskovalec |
2023 - 2025 |
191 |
0106 Institut "Jožef Stefan"
št. |
Evidenčna št. |
Ime in priimek |
Razisk. področje |
Vloga |
Obdobje |
Štev. publikacijŠtev. publikacij |
1. |
55529 |
Petra Čotar |
|
Tehnični sodelavec |
2023 - 2024 |
14 |
2. |
38854 |
dr. Boštjan Kokot |
Fizika |
Tehnični sodelavec |
2023 - 2025 |
35 |
3. |
32057 |
dr. Iztok Urbančič |
Fizika |
Raziskovalec |
2023 - 2025 |
154 |
Povzetek
Brezmembranski kompartmenti, ki se tvorijo ob kondenzatih lncRNA, so ključnega pomena za razvoj in so tesno povezani z nevrodegenerativnimi boleznimi. Potrebno jih je razmejiti in modulirati njihovo sestavo, da bi razumeli delovanje teh oddelkov. V predlaganem projektu bomo raziskovali, kako lahko ena specifična lncRNA, NEAT1, deluje kot ""seme"" za sestavljanje kompleksa ribonukleoproteinov z visoko lokalno kondenzacijo v brezmembranski kompartment imenovan parapega. NEAT1 spodbuja fazno ločevanje RNA vezavnih proteinov, kar je močno odvisno od raznolikosti interakcij, ki jih tvorijo intrinzično neurejena območja (ang. intrinsically disordered regions, IDR) RNA vezavnih proteinov (ang. RNA Binding Proteins, RBP), ki so sestavni del parapeg. Ti IDR-ji parapeg RBP so pogosto mesta mutacij, ki povzročajo bolezni, mutirani RBP pa imajo tudi povečano nagnjenost k prehodu iz tekoče v trdno fazo, kar je pogost znak več nevrodegenerativnih bolezni. Predvidevamo, da post-translacijske modifikacije IDR-jev narekujejo potencial tvorjenja kompartmentov ob kondenzatih lncRNA in so povezani z večanjem sposobnosti RBP-jev, da imajo na različnih stopnjah razvoja več vlog v regulacijskih omrežjih RNA.